"常用生物软件(windows)全面介绍"
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更新于2024-02-28
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Pro 一种可用于对数组图像进行完全全自动分析和定量的软件,它可以从 gel, array, blot 等图像数据中提取出定量的结果。2、基因芯片数据分析软件。 GeneSpring,该软件功能强大,可用于对基因表达及 SNP 数据进行分析,同时也可以进行通路或者 gene ontology 的分析,同时还可以和 mass spectrum 相连接,功能比较全面,当然价格也不菲。3、 EST 和 SAGE 数据分析。 SeqMan II DNAStar公司的产品,主要用于 EST 和 SAGE 数据的比对分析和序列拼接。 Phrap 一个免费的序列拼接软件,目前应用很广泛。
二、核酸和蛋白序列分析1、序列比对。 ClustalX 基于 windows 的多序列比对软件,同时还可以用于序列的树式分析。2、 Motif 分析。 MEME 一个用于找 motif 的软件,功能强大且易于使用。3、 RNA 的二级结构分析。 mfold,一种用于 RNA 二级结构分析的软件,也是免费的。4、蛋白结构。 RasMol 一个用于在 windows 平台上查看蛋白结构的软件。
三、数据库1、数据库搜索。 Entrez,NCBI 提供的一个非常好的检索软件,可以检索出整个基因组的 mRNA, EST 等序列。2、数据库管理。 ACEDB 一个较老的数据库,但至今仍在使用,应用于生物实验室,相信不少人还在用。3、生物信息学数据库的搜索和分析。 GeneQuest,一个分析和搜索 DNA 和 protein 序列的神器。
四、图表绘制和排版1、图表绘制。 SigmaPlot 一个专业绘制各种科学图表的软件。2、排版。 EndNote,一个专业的文献排版软件。
以上软件是部分生物软件中的常用软件,虽然有些软件价格不菲,但功能和使用广泛性还是比较显著的。不同软件的使用还取决于具体的实验类型和实验需求。 Bioinformatics(生物信息学)的日益发展,使得这些软件的使用也变得越来越广泛。
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