SPM12手册:脑成像数据分析的关键工具
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更新于2024-07-09
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SPM (Statistical Parametric Mapping) 是一种基于 MATLAB 的高级软件包,专为医学影像处理和统计分析而设计,特别是针对功能性磁共振成像(fMRI)、正电子发射断层扫描(PET)和单光子发射计算机断层扫描(SPECT)等脑成像技术。该软件由伦敦大学学院(UCL)功能成像实验室(Functional Imaging Laboratory)的 Friston 教授团队开发,包括 John Ashburner、Gareth Barnes 等多名荣誉成员。
SPM12 Manual 主要涵盖了两个核心部分:时间序列处理和空间处理。
1. **时间序列处理**:
- **Slice Timing**:这是对不同层面扫描时间校准的过程,确保在统计分析前的时间一致性。涉及的因素包括每个扫描中的session、图像层数、重复时间(TR)、回波时间(TE),以及扫描顺序和参考层面的选择。例如,通过指定每个slice采集的时间,可以纠正因机器操作导致的信号延迟。
- **Realign**:此步骤包括估计运动校准和图像重采样,目的是消除由于头部运动引起的信号漂移。它提供了不同的选项,如数据输入、估计参数调整(如平滑度、旋转速度等)和重采样设置,以提高数据的稳定性。
2. **空间处理**:
- **Realign: Estimate**:这一阶段主要负责对整个扫描序列进行空间配准,通过对不同时间点的数据进行比对,找出并纠正头部的位置变化。
- **Realign: Reslice**:接着进行图像的空间重采样,将所有时间点的图像转换到统一的空间模板上,便于后续的分析。
- **Realign: Estimate & Reslice**:结合了前面两个步骤,一次性完成配准和重采样,提供灵活的选项以适应特定的分析需求。
SPM12 Manual 提供了详细的步骤和参数设置指南,确保用户能够正确地预处理数据,减少噪声,补偿运动伪影,并准备数据进行统计分析。此外,该手册还包含了日期(2020年1月13日)和链接(https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/),显示它是一个最新的专业工具,反映了当时的技术状态和最佳实践。
SPM12是医学成像研究中不可或缺的工具,它通过强大的统计方法处理和分析数据,为深入理解大脑功能和结构提供了强有力的支持。通过掌握其操作流程和参数设置,研究人员能更准确地解读和解释脑成像结果。
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2024-11-07 上传
2024-10-27 上传
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2024-10-30 上传
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剑剑哥哥
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