NICE细菌菌落自动计数器：MATLAB集成C代码开发

资源摘要信息:"matlab集成c代码-NICE-Public:NIST的综合殖民地枚举器（NICE）" NICE是美国国家标准技术研究院（NIST）开发的一款综合殖民地枚举器，它将C代码集成至Matlab环境中，用于自动计数琼脂平板中的细菌菌落。NICE的开发版本为1.4，代号B.2.c，发布于2020年4月。该软件特别针对Windows 10 64位系统以及MATLAB 2016b版本进行了适配和修改。 NICE项目主要由Matthew Clarke和Jeeseong Hwang负责开发，他们均来自NIST的应用物理部，工作地点位于科罗拉多州Boulder的80305号。同时，该项目还得到了阿拉巴马大学伯明翰分校的Robert Burton和Moon Nahm的合作支持。 NICE的设计初衷是为了解决在实验室中，琼脂平板上细菌菌落计数过程中遇到的问题。传统的人工计数方法不仅耗时耗力，而且容易受到菌落颜色、大小、形状和对比度等多种因素的影响，导致结果出现误差。NICE项目旨在提供一种低成本、高通量的自动计数解决方案，以提高实验效率和准确性。 NICE的核心功能是通过图像处理技术，自动检测并计数平板上的细菌菌落。为了实现这一点，NICE整合了多种图像处理算法，使得软件能够在不同的实验条件下，准确识别菌落，并进行计数。软件的开发参考了Clarke等人的研究论文《低成本，高通量，细菌菌落自动计数》，该论文发表于2010年的细胞计数法A，卷77A，页码为790-797。 NICE软件的下载链接已提供，供感兴趣的用户下载使用。有关NICE的MATLAB代码，用户可以通过联系相关的PATH部分获得支持。需要注意的是，作者在发表软件时声明，他们的观点可能并不代表PATH的观点。 在技术实现方面，NICE软件充分利用了Matlab强大的矩阵运算和算法库，并嵌入了高效、优化的C语言代码以提高执行效率。软件的用户界面友好，允许用户通过直观的交互界面轻松配置计数参数，并进行图像采集和分析。NICE软件同样支持批处理功能，可以在用户设置好参数后，自动对一系列平板图像进行连续处理。 该软件的使用范围广泛，不仅限于微生物学研究，在其他需要菌落计数的生物医学研究中同样具有应用价值。NICE的出现，无疑为广大研究人员提供了一个高效、可靠的菌落计数工具，显著提升了研究效率，并为后续的数据分析和实验设计提供了便利。 最后，NICE项目被标记为"系统开源"，这意味着该项目源代码对公众开放，研究人员可以根据自己的需要进行修改和二次开发。开源的特性不但能促进技术交流，还能够加快科研成果的共享速度，推动相关领域研究的深入发展。对于希望参与或了解NICE项目的个人和组织来说，开源提供了一个极好的机会去贡献自己的力量，并从中获取益处。