R语言交叉验证建模:获取预测值平均与标准差
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更新于2024-08-03
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"R语言建模并使用交叉验证是机器学习中常见的模型评估方法,它有助于避免过拟合,提高模型泛化能力。在R语言中,通过将数据集分割成多个子集(fold),每次用一部分数据作为验证集,其余部分作为训练集,反复进行100次这样的过程。在本例中,我们看到代码片段展示了如何在循环中应用支持向量机(SVM)模型,并计算每个样本点的预测值平均值和标准差。
首先,我们需要创建两个空列表`train_pred_all`和`test_pred_all`来存储每个样本在100次交叉验证中的预测值,以及两个列表`train_pred_sd`和`test_pred_sd`来存储对应的预测值标准差。接着,通过`for`循环遍历100次,每次将`folds[[i]]`作为训练集,其余数据作为验证集。在这里,`bb`可能是数据框,而`folds`是一个分割数据的列表,可能是使用`cvpartition`函数创建的交叉验证折叠。
在循环内部,我们训练一个径向基函数(radial basis function, RBF)核的支持向量机模型,然后使用`predict`函数对训练集和验证集进行预测,将结果分别存储在`train_pred_all`和`test_pred_all`对应的子列表中。同时,计算每个样本的预测值标准差,存储在`train_pred_sd`和`test_pred_sd`中。
最后,使用`sapply`函数分别对`train_pred_all`和`test_pred_all`的列表进行平均值计算,得到每个样本的100次预测值的平均值,存储在`train_pred_mean`和`test_pred_mean`中;同样地,对`train_pred_sd`和`test_pred_sd`计算标准差,得到存储在`train_pred_sd`和`test_pred_sd`中的结果。
这个过程不仅帮助我们评估模型的性能,还可以提供每个样本预测的稳定性和不确定性,标准差可以反映预测值的波动程度。通过这些统计量,我们可以分析模型在不同子集上的表现,进一步优化模型参数或选择更适合的数据预处理方法。"
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