三环类COX-2抑制剂的3D-QSAR研究：CoMFA与SOMFA应用

"三环类环氧合酶抑制剂的三维定量构效关系研究 (2007年)，北京化工大学学报，第34卷第3期，2007年" 这篇论文深入探讨了三环类选择性环氧合酶-2（COX-2）抑制剂的三维定量构效关系（3D-QSAR）。环氧合酶是一种关键的生物酶，参与花生四烯酸的代谢，生成前列腺素，与炎症反应密切相关。COX-2抑制剂因其在抑制炎症同时减少胃肠道副作用而备受关注，广泛应用于治疗风湿性关节炎和骨关节炎。 论文中，研究人员针对30个三环类COX-2抑制剂进行了结构优化，首先运用MMFF94分子力学方法进行初步优化，接着采用PM5半经验量子化学方法进行全优化，并加载MOPAC电荷。这些化合物以其共同的三环结构为基准进行分子叠合。随后，他们运用了两种不同的3D-QSAR方法：比较分子力场分析（CoMFA）和自组织分子力场分析（SOMFA）。 CoMFA方法基于结构相似的化合物具有类似的生物活性，认为化合物的生物活性与其周围分子场的分布有关。这个方法通过计算探针分子在分子场中的能量变化来建立模型。SOMFA则更为简化，它不需计算探针能量，而是利用分子本身的形状和静电势来构建QSAR模型，更直观且避免复杂的统计处理。 研究结果显示，这两种力场分析方法建立的模型都能够解释已知的构效关系，并对同类化合物的生物活性有较好的预测能力。特别指出，CoMFA方法在预测效果上表现得更为出色。这一研究对于理解和设计新的、更有效的COX-2抑制剂具有重要意义，有助于药物研发人员在药物设计过程中更好地预测和优化化合物的生物活性，从而提升药物性能。