USDA食品数据库:数据预处理与营养成分分析
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更新于2024-09-01
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USDA食品数据库是一个包含丰富营养信息的资源,它以JSON格式存储在GitHub上的`pydata-book/datasets/usda_food/database.json`文件中。该数据库主要用于研究、分析和展示各类食物的营养成分数据,支持数据科学和健康相关的应用。
在进行数据分析之前,首先需要导入必要的Python库,如NumPy用于处理数组,Pandas用于数据处理和DataFrame操作,Matplotlib和Seaborn用于数据可视化,以及一些辅助库如`rcParams`和`rainbow`来定制图表风格。为了避免不必要的警告信息,我们导入了`warnings`模块并设置了`filterwarnings`和`set_printoptions`。
1. 读取文本文件:利用`json.load()`函数加载数据库文件,得到一个包含所有食物数据的字典`db`。每个条目都是一个包含食物详细信息的字典,其中的'nutrients'字段是一个列表,包含各种营养成分的具体数值。通过`len(db)`可以了解数据的规模,而`db[0]`和`db[0].keys()`展示了数据库的第一个记录及其键(营养成分)。
2. 数据预处理:
- 将营养成分数据提取出来,创建一个名为`nutrients`的DataFrame,以便于后续操作。这一步将`db[0]['nutrients']`转换为表格形式。
- 同时,为了获取食物的元信息(如描述、类别、编号和制造商),创建另一个DataFrame `info`,选择需要的键值`info_keys`作为列名。
3. 数据探索:
- 使用`pd.value_counts()`函数统计食物类别的分布,可以直观地看到各类食物的数量。例如,`pd.value_counts(info.group)[:10]`显示的是最常见的前10个食物类别。
4. 转换与整合数据:
- 对于每个记录,通过循环`for rec in db:`,将营养成分数据转换成DataFrame,然后添加一个表示编号的列。这些DataFrame被添加到一个列表`nutrients_list`中。
- 最后,使用`pd.concat()`函数将所有这些单独的DataFrame合并成一个大的营养成分DataFrame,这可能是一个耗时的操作,所以使用`%%time`装饰器来测量时间。
通过这些步骤,你可以对USDA食品数据库进行深入的数据清洗、处理和分析,从而获取有用的信息,比如食物的营养成分对比、类别间的营养特性差异等。这在营养学研究、饮食建议或健康应用开发中都是非常有价值的资源。
2021-05-03 上传
2018-03-01 上传
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2018-04-09 上传
2023-03-15 上传
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