python 提取文件指定列的方法示例

python 提取文件指定列的方法示例提取文件指定列的方法示例

主要介绍了python 提取文件指定列的方法示例，文中通过示例代码介绍的非常详细，对大家的学习或者工作具

有一定的参考学习价值，需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧

之前用featureCount 处理得到结果，要提出第一列gene_id 和 readcount 列，首先软件输出的第一行默认是你使用的命令行，

没有用，用bash批量删掉。

for i in `ls`;do sed -i '1d' $i;done

删除当前文件夹下所有文件第一行。

其实提出两列很简单，不过我受够了每次一个文件执行一次的烦。想搞成别的程序调用时命令行参数直接就行。第一次知道

for i in range(leng): # index the input file and output file location,maybe it's too complex

if sys.argv[i]=="-i":

it=i

if sys.argv[i]=="-o":

out=i

for i in range(it+1,out): # input file number(there should have same # of in and out file)

print(sys.argv[i])

file=open(sys.argv[i],'r')

f=open(sys.argv[i+out-it],'w')

count=[]

b[6]="count"

two.append(b[6])

s=' '.join(two)

f.write(s+'\n')

f.close

其实python里面 str 和list 弄的还是昏头昏脑的，每次都要错了再改。

以上就是本文的全部内容，希望对大家的学习有所帮助，也希望大家多多支持我们。