NTSYS-PC聚类分析详述：避免常见错误与步骤详解

NTSYS-PC是一款强大的生物信息学软件，主要用于基因表达数据分析中的聚类分析。本文将详细介绍如何正确使用NTSYS-PC进行聚类分析，特别是针对容易出错的部分。 首先，准备工作是关键。在Excel中，你需要遵循特定格式输入数据。例如，A列代表是否存在带标记，1表示存在，0表示不存在；B列记录扩增的总条带数；C列包含样本数量；D列则是无带标记的情况。从第二行开始，A列是引物名称，样本名称从第二行开始。确保文件以Microsoft Excel 5.0/95格式保存，因为后续步骤依赖于此格式。 在NTSYS-PC中，首先打开程序，点击"Similarity"，然后选择"Qualitative data"。接着导入数据文件（可能是95版本的Excel或经过转换的NTS格式）。在导入过程中要注意，如果尝试打开03版Excel文件，可能会遇到"erroloading"错误，需确保是正确的文件格式。 接下来，进行系统树的生成。点击"Compute"，随后选择"Clustering"，并设置"SHAN"选项。选择合适的参数后，再次点击"Compute"生成聚类结果。此时，你可以创建图形，通过点击"Treeplot"绘制聚类图，展示样本间的遗传关系。 对于遗传相似度的计算，进入"File"菜单，选择"Editfile"打开文件A，对数据进行编辑后再次点击"Compute"，就能得到遗传相似度表。这一步是评估样本间遗传差异的重要依据。 NTSYS-PC的功能虽然强大，但本文主要讲解了聚类分析和遗传相似度计算的基本操作。如果你还想了解其他高级功能，如遗传距离的计算，可以按照以下步骤： 1. 打开Ntsyspc 2.1，找到"File"菜单，选择"Editfile"。 2. 导入数据文件A，确保位于C:\桌面。 3. 编辑完数据后，进行"GeneticDistance"的计算，通常会有一个专门的计算选项或者菜单项引导你完成这一过程。 通过以上步骤，你可以有效地使用NTSYS-PC进行聚类分析，并理解其中的关键操作和可能遇到的问题。实践过程中，不断熟悉软件界面和功能，才能更好地应用到实际研究中。