PopGene 使用说明 翻译 by ：一路忘了哭
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Exp. Homozygosity:判断 随即杂 交的 情况下 ，预想 杂合 子的 比 例， 仅 对于
co-dominant markers
Shannon Index: 判断 Shannon 信息指数，以此作为基因多样性的程度
Homogeneity Test: 构建双向相依表和进行(χ
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)和相似率(G2)测试，测试针对于
Groups 或者 Multiple Populations
F-Statistics: 为 Groups 或 Multiple Populations 判断 F-statistics
Gene Flow: 从 GST 或 FST 中的判断中来进一步判断基因流
Genetic Distance: 判断 Nei’s (1972)遗传特性和遗传距离以及不偏遗传特性和遗
传距离
Dendrogram: 用 UPGMA 做基于 Nei’s 遗传距离的树形图
Neutrality Test:用 Manly 提出的算法，为临界稳定执行 Ewens-Watterson 测试
Two-locus LD: 判断 loci 和 χ
2
测试之间的 gametic disequilibria
Smouse: 编码常出现的等位基因为 1，假的等位基因为 0，他们的异形接合体为
1/2. 判断平均内在关系
三、软件的使用
输入文件格式
输入文件应该由表头和数据两部分构成。表头的格式应该是这样：（1）用
/* ... */符号限定；（2）populations 的数量；（3）loci 数量；（4）locus 的名字。
数据开始为每个 population 的 ID #和 population 的名字 ，这两个都是可
选项。如果这两项没有给出的话，就应该在 populations 之间留下至少一个空白
行，该软件会自动给你产生 population 的 ID。如果这两项给出来的话，你的
population 的 ID#和 population 的名字之间必须是不重复的。原始数据的格式很
自由，纵行之间可以带或不带 1 个或更多的空格，但他们之间不能有空行。对于
haploids 和 dominant markers 像 RAPDs 无值的位置要以“ .“代替（也就是
说把出现或未出现等位基因的代表为一个点），对 diploids co-dominant markers
的用“ . .“。下面给出三个例子。头两个例子纵行之间有空格，第三个数据中是
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