比较:商品化Trizol法提取马铃薯块茎总RNA的效果与优化
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更新于2024-09-04
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"这篇论文‘商品化Trizol法提取高质量马铃薯块茎总RNA的比较’由刘柏林、尤佳等人撰写,是首发论文,得到了高等学校博士学科点专项科研基金和国家自然科学基金的支持。文章主要探讨了针对马铃薯块茎中多糖多酚特性,如何使用三种不同的商品化Trizol试剂来有效地提取高质量的总RNA。"
在分子生物学实验中,RNA的提取是基础且关键的步骤,尤其是对于像马铃薯这样含有复杂成分如多糖和多酚的植物组织。这些成分可能会降解RNA或干扰其提取。本研究中,作者选取了三种常见的商品化Trizol试剂,通过对马铃薯块茎的处理,评估了它们在提取总RNA时的效果、纯度和浓度。
实验结果显示,所有测试的试剂都能在一定程度上成功提取出马铃薯块茎的总RNA,而且在电泳中显示出28S、18S和5SrRNA的主要条带,这是评估RNA完整性的重要指标。然而,不同试剂间的纯度和浓度差异显著。其中,使用Trizol裂解结合柱吸附的方法提取的总RNA纯度最高,但浓度相对较低。尽管如此,这种提取的RNA仍然足够用于后续的分子生物学实验,如通过LD-PCR(低密度聚合酶链反应)和SMART PCR技术,可以成功扩增出马铃薯块茎的全长双链cDNA以及腺苷葡萄糖磷酸化酶小亚基(sAGP)基因。
sAGPase是一种关键的酶,在植物碳代谢中起着重要作用,其基因的分析有助于理解马铃薯的生理过程。SMART(Switching Mechanism At the 5' end of RNA Transcript)技术是一种用于全长度cDNA合成的方法,而LD-PCR则是一种增强PCR扩增效率的策略,尤其适用于低拷贝数或低质量模板。
该研究提供了一种优化的马铃薯总RNA提取方法,对于进一步研究马铃薯基因表达、代谢途径及其遗传改良具有重要意义。这些发现为马铃薯分子生物学研究提供了实验技术支持,同时也为其他富含多糖多酚的植物组织的RNA提取提供了参考。
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2021-09-27 上传
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