NIRS_SPM软件详细操作指南:从数据转换到分析
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更新于2024-07-20
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"NIRS_SPM 是一种专门用于分析近红外光谱成像(NIRS)数据的软件工具,旨在简化数据处理流程,包括数据转换、预处理、统计推断和组分析。该软件需要MATLAB 7 和 SPM5 作为运行环境,并对硬件有特定的内存要求。用户可以从指定的下载地址获取nirs_spm 安装包,通过MATLAB 的路径设置进行安装。在MATLAB 命令窗口中启动nirs_spm 后,用户将进行一系列步骤,如独立定位(Registration)、数据转换(Data Convert),将光强数据转化为血红蛋白浓度变化数据,并保存为.mat 格式。后续步骤涉及第一级分析参数设定、估计(Estimate)计算,这一步可能耗时较长,接着进行统计推断(Inference),包括单体素和组分析,最终产生如SPM_indiv_HBO 和 SPM_group_HBO 等结果文件。"
NIRS(近红外光谱成像)是一种非侵入性的脑功能成像技术,通过测量大脑组织对近红外光的吸收变化来评估血氧水平依赖(BOLD)信号,从而推断大脑活动区域。NIRS_SPM 软件包是针对NIRS 数据的一种强大分析工具,尤其适用于研究大脑活动和认知功能。
1. **软件和硬件要求**:
NIRS_SPM 的运行需要MATLAB 7 及SPM5 插件,这是由伦敦大学学院神经影像研究所开发的统计参数映射软件。同时,至少需要2.0GB 的RAM 以确保程序的正常运行。
2. **安装与启动**:
用户需要从指定网址下载nirs_spm 安装包,解压后在MATLAB 中设置路径,将nirs_spm 文件夹添加到搜索路径,然后在命令窗口中输入`nirs_spm` 来启动软件。
3. **Registration(注册)**:
这一步是进行空间配准,确保数据对应于标准的大脑模板,以便后续分析。
4. **Data Convert(数据转换)**:
在这个阶段,原始的光强数据被转化为血红蛋白浓度的变化值,这通常涉及到光学密度转换、偏置校正和动力学模型的运用。
5. **预处理与设计矩阵**:
预处理可能包括去除噪声、平滑、时间点对齐等,而设计矩阵则定义了实验条件和期望响应的模式,这一步涉及对第一级分析的参数选择。
6. **Estimate(估计)**:
这一步执行模型估计,计算每个体素的参数,基于预处理后的数据和设计矩阵。
7. **Inference(推断)**:
推断阶段包括单体素统计分析,检验特定假设下的显著性,以及组分析,比较不同受试者之间的差异。
8. **结果输出**:
最终,软件会生成表示个体和群体分析结果的文件,例如SPM_indiv_HBO 和 SPM_group_HBO,这些文件可以用于进一步的视觉化或统计分析。
NIRS_SPM 提供了一套全面的工具,使得研究人员能够系统地分析NIRS 数据,揭示大脑活动模式,对于理解大脑功能和研究脑疾病具有重要意义。尽管这里没有详细讲述每一步的具体操作,但通过软件提供的操作手册,用户可以详细了解每个步骤的细节。
2024-08-15 上传
2023-03-29 上传
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2023-08-01 上传
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