"LSF训练-作业管理和提交"
在高性能计算(HPC)环境中,作业管理和调度是关键任务。这里介绍的是Platform LSF (Load Sharing Facility)系统,一个广泛使用的集群作业调度器。通过学习如何在LSF中进行作业提交、管理以及资源监控,用户可以有效地利用计算资源。
首先,我们可以看到在描述中提到了几个用于作业管理的命令:
1. `bjobs`:用于查看作业的状态。例如,`bjobs` 命令列出当前用户的作业状态,而`bjobs -a 818`则显示特定作业ID(818)的详细信息。
2. `bstop`:停止作业。如`bstop 818`命令会尝试停止作业ID为818的运行。
3. `bresume`:恢复暂停的作业。`bresume 818`会让作业ID为818的作业继续执行。
4. `bkill`:终止作业。`bkill 818`会强制结束作业ID为818的执行。
这些命令对于监控和控制作业执行流程至关重要,尤其是对于需要及时响应资源需求变化的环境。
接着,我们注意到`bhist`命令用于查看作业的历史记录,但应避免在LSF主节点上对大量数据运行此命令,因为它可能消耗大量内存和CPU资源。
此外,`btop` 和 `bbot` 是用于资源管理的高级命令,通常只由LSF管理员使用。`bswitch` 命令则用于在不同队列之间重定向大量作业,这在需要调整资源分配策略时非常有用。
在作业提交方面,LSF提供了`bsub`命令。例如,提交Gauss作业时,使用`bsub -W60 -n32 -qQN_Norm g03.lsftest397.com`,其中`-W60`定义了作业最大运行时间,`-n32`指定了需要的CPU核心数,`-qQN_Norm`指定了队列名称,`g03.lsftest397.com`是作业脚本。同样,提交Dock作业时,`bsub -W12:00 -aopenmpi -n4 mpirun.lsf`, `-aopenmpi` 指定使用OpenMPI运行,`-W12:00` 设置作业最长运行12小时,`-n4` 需要4个处理器。
在设置LSF环境变量方面,用户可以通过`env | grep LSF`查看相关的环境变量,如`LSF_SERVERDIR`、`LSF_LIBDIR`、`LSF_VERSION`等,这些变量对于正确配置和使用LSF系统至关重要。
最后,关于故障分析和系统监视没有提供具体细节,但它们是确保LSF系统稳定运行的关键环节。故障分析可能涉及到日志检查、性能监控工具的使用,以及与LSF管理员的沟通。系统监视可能涉及使用LSF提供的监控工具,如`bmon`和`lsvg`,来查看系统资源的利用率、作业队列的状态等。
熟悉并熟练掌握这些命令和概念,用户就能在Platform LSF环境中高效地提交、管理和监控作业,充分利用集群计算资源。