磁性微阵列结合荧光杂交法:SNP分型的新策略
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更新于2024-08-30
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本文主要探讨了一种创新的分子生物学技术——基于磁性颗粒微阵列与双色荧光杂交的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)分型方法。该方法由东南大学生物电子学国家重点实验室和湖南工业大学绿色包装与生物纳米技术应用湖南省重点实验室的研究团队共同开发,旨在提高遗传标记的检测效率和准确性。
首先,不对称PCR扩增技术被用来直接生成高产的单链DNA,这些DNA带有待测的SNP位点并被生物素标记。生物素标记的单链PCR产物随后被固定在链亲和素修饰的金磁纳米颗粒(Gold Magnetic Nanoparticles, GMNPs)表面,形成一个生物化学锚定系统。这种设计使得后续的操作更为简便,因为GMNPs可以被磁力控制,方便在磁性颗粒微阵列上进行定点定位。
磁性颗粒微阵列是在一块底部固定有磁铁的载玻片上构建的,通过将ssDNA-GMNPs混合物精确点样,实现了高通量和有序的布局。在此阵列中,SNP位点与预合成的双色荧光探针进行特异性杂交。双色荧光探针的设计允许同时检测两种可能的等位基因,从而区分不同的SNP类型。
杂交完成后,通过彻底清洗去除未结合的探针,然后通过扫描仪读取信号,即可获取SNP分型的结果。这种方法的优势在于其操作步骤简化,便于自动化处理,对于大规模的分子诊断和法医鉴定具有很高的实用价值。
作者们通过实际应用,对24个样本的MTHFR基因C677T位点进行了验证,结果显示该方法具有良好的灵敏度和特异性。研究得到了国家自然科学基金、863国家高技术研究发展计划、国家重点基础研究发展计划等多个项目的资金支持,体现了其在遗传学研究中的重要地位和广泛应用前景。
这项工作为大规模SNP分型提供了高效且易于操作的解决方案,对于个性化医疗、疾病风险评估以及法医学等领域具有显著的实际意义。随着科技的进步,这种结合了磁性技术和荧光标记的SNP分型方法有望在未来的技术发展中发挥更大的作用。
2021-02-23 上传
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