"这篇文档详细记录了在64位操作系统上使用IFC编译器和MKL数据库编译VASP软件的过程,同时介绍了如何安装MPICH2进行并行计算。"
在高性能计算领域,VASP(Vienna Ab initio Simulation Package)是一个广泛使用的量子力学模拟软件,用于材料科学和化学的研究。为了在64位系统上充分利用计算资源,通常需要对其进行编译以适应特定的硬件和环境。以下是对给定内容的详细解释:
1. **准备阶段**:
- 首先确保操作系统是64位的,例如Opensuselinux 10.3或11.0。
- 获取VASP的源代码(vasp.4.6.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz),这是编译的基础。
- 同时需要获取Intel的数学核心库(Math Kernel Library, MKL)数据库,用于优化线性代数运算,提高计算效率。
- 安装Intel的IFC(Intel Fortran Compiler)编译器,它支持Fortran语言,对于科学计算软件至关重要。
2. **IFC编译器安装**:
- 解压IFC编译器的tar包,进入安装目录并运行`install.sh`脚本进行安装。
- 安装完成后,将`ifort`链接到`bin`目录,以便于后续使用。
3. **MKL数据库安装**:
- 解压MKL数据库,然后在解压后的目录中执行`install.sh`,默认安装到指定目录。
- MKL包含了大量的优化库,如BLAS(Basic Linear Algebra Subprograms)、LAPACK(Linear Algebra PACKage)等,对VASP的矩阵运算提供高效支持。
4. **安装MPICH2**:
- MPICH2是一个实现MPI(Message Passing Interface)协议的并行计算框架,用于分布式内存计算。
- 解压MPICH2源码,创建安装目录,然后使用`configure`、`make`和`make install`进行编译和安装。
- 安装完成后,需要更新`~/.bashrc`文件以设置环境变量,确保系统能找到MPICH2的相关程序。
通过这些步骤,用户可以构建一个支持并行计算的64位VASP环境。在实际运行VASP时,利用MPICH2的并行能力,可以大幅提升计算速度,尤其在处理大规模的模拟问题时,效果显著。同时,IFC和MKL的结合使用能确保代码的优化执行,减少计算时间。记得在完成所有安装后,重新加载`~/.bashrc`文件使改动生效,并根据需求配置VASP的输入参数,以进行精确的量子力学模拟。