PCA算法的Matlab实现与应用例程

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0 下载量 200 浏览量 更新于2024-10-29 收藏 2KB RAR 举报
资源摘要信息:"PCA_Nicolas.rar是一个包含PCA(主成分分析)算法的Matlab例程压缩包文件。主成分分析是一种常用的数据降维技术,它的目的是通过正交变换将一组可能相关的变量转换为一组线性不相关的变量,这些新的变量被称为主成分。在很多领域,如图像处理、统计分析和机器学习中,PCA都被用于提取数据的重要特征,减少数据的维度,同时尽可能保留数据的原始信息。 这个压缩包中的PCA_Nicolas文件很可能包含一个Matlab脚本或函数,能够实现PCA算法。它可能包含了以下知识点: 1. 数据预处理:包括数据标准化或归一化,确保不同特征具有相同的尺度,这对于PCA算法的正确运行至关重要。 2. 协方差矩阵计算:PCA的第一步是计算数据集的协方差矩阵,这有助于找到数据中各个变量之间的相关性。 3. 特征值和特征向量:通过求解协方差矩阵的特征值和特征向量,可以找到数据中的主成分。特征值最大的那些特征向量对应于数据中方差最大的方向。 4. 投影到新的空间:将原始数据投影到由特征向量构成的新空间上,得到主成分的分数。这些分数构成了原始数据的低维表示。 5. 方差解释:通常会计算每个主成分解释的方差比例,这有助于确定应该保留多少主成分。通常会选择累计解释方差达到特定百分比(如95%)的主成分。 6. 代码的易用性和可修改性:作为一个例程,该文件可能设计得易于理解和修改,以便用户可以根据自己的需求调整PCA算法的参数或进行其他定制化操作。 在使用此PCA_Nicolas例程之前,用户可能需要具备一定的Matlab编程能力和PCA算法的理解。Matlab是一种高性能的数学计算软件,广泛应用于工程和科学计算领域。它提供了大量的内置函数和工具箱,可以方便地进行矩阵运算、数据分析、算法开发等工作。 使用PCA_Nicolas例程时,用户可能需要按照以下步骤操作: a. 解压PCA_Nicolas.rar压缩包以获取PCA_Nicolas.m文件。 b. 阅读并理解PCA_Nicolas.m文件中的代码,根据需要进行修改或调整。 c. 准备数据集,并确保数据格式与PCA_Nicolas.m文件所期望的格式一致。 d. 运行PCA_Nicolas.m脚本,在Matlab环境中执行主成分分析。 e. 分析输出结果,包括每个主成分解释的方差比例和数据的新低维表示。 f. 根据实际需要进一步处理或分析数据。 最后,值得注意的是,PCA算法虽然强大,但也存在一些局限性,比如它对数据的分布有一定的假设,并且在面对非线性关系时可能不如非线性降维方法(如核PCA或t-SNE)有效。因此,在选择降维技术时,需要根据数据的特性和分析的目的来决定是否适用PCA。"

优化这段代码 for j in n_components: estimator = PCA(n_components=j,random_state=42) pca_X_train = estimator.fit_transform(X_standard) pca_X_test = estimator.transform(X_standard_test) cvx = StratifiedKFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) cost = [-5, -3, -1, 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15] gam = [3, 1, -1, -3, -5, -7, -9, -11, -13, -15] parameters =[{'kernel': ['rbf'], 'C': [2x for x in cost],'gamma':[2x for x in gam]}] svc_grid_search=GridSearchCV(estimator=SVC(random_state=42), param_grid=parameters,cv=cvx,scoring=scoring,verbose=0) svc_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) param_grid = {'penalty':['l1', 'l2'], "C":[0.00001,0.0001,0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100, 1000], "solver":["newton-cg", "lbfgs","liblinear","sag","saga"] # "algorithm":['auto', 'ball_tree', 'kd_tree', 'brute'] } LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=0) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) var = Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

2023-07-14 上传

把这段代码的PCA换成LDA:LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=1) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

2023-07-22 上传