MIT Supercloud & LLSC HPC系统代码提交流程教学

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资源摘要信息: "teaching-examples: 从如何成功并行化代码到如何在HPC系统上提交该代码的HPSC工作流程教学示例" 知识点详细说明: 1. 并行化代码的重要性与方法: - 并行化是指将大型计算任务分解成多个较小的子任务,这些子任务可以在多个处理器上同时执行,从而加快计算速度并提高效率。 - 示例中涉及的并行化编程语言可能包括但不限于C/C++、Fortran、Python等,每种语言都有其特定的并行化库和方法,例如MPI、OpenMP等。 - 成功并行化的代码需要考虑负载均衡、任务分解、同步与通信等多个方面。 - 在编写可伸缩代码时,需要识别任务中的并行部分,并设计成可以利用多核处理器或分布式计算资源的结构。 2. HPC系统概念与工作流程: - 高性能计算(HPC)系统通常指代拥有高速处理能力的计算机集群,能够执行大规模复杂计算任务。 - HPC系统的典型工作流程包括任务提交、任务调度、资源分配、计算执行、结果收集等步骤。 - Slurm是HPC领域广泛使用的一种作业调度和资源管理软件,负责管理系统资源并高效分配给不同的计算任务。 3. Slurm提交脚本与调度策略: - Slurm提交脚本定义了运行作业的指令和资源请求,包括CPU核心数、内存大小、运行时间等参数。 - 学习如何编写Slurm作业脚本对于在HPC系统上成功运行代码至关重要。 - 示例中提供的Slurm脚本和说明是基于MIT Supercloud和LLSC的特定环境,如果在其他使用Slurm的HPC系统上运行,可能需要根据相应系统的配置和规则进行调整。 4. 教学示例的组织结构: - 示例按照编程语言、任务类型(序列、吞吐量/作业数组、map reduce、完全并行)以及具体问题进行组织。 - 这种结构化的方式有助于学习者从不同角度和层次理解并行编程及其在HPC系统中的应用。 - 示例中使用到的数据和脚本分布在不同目录层级,符合实际项目中文件组织和管理的需要。 5. Jupyter Notebook的使用: - Jupyter Notebook是一种交互式计算工具,支持多种编程语言,特别适合数据分析、数据科学、教育等领域。 - 教学示例的存储库中包含了Jupyter Notebook文件,意味着学习者可以通过Jupyter Notebook直接在浏览器中运行、编写和测试代码。 - Jupyter Notebook提供了一个可视化的环境,支持代码、文本、公式、图表和多媒体内容的混合展示,方便学习者进行实验和学习。 6. MIT Supercloud和LLSC特定环境说明: - MIT超级云和林肯实验室超级计算中心使用特定的硬件和软件配置,可能包含特定的网络架构、存储系统和软件库。 - 示例中可能包含与这些特定环境相关的优化策略和注意事项。 - 学习者在迁移或调整示例到其他HPC系统时需要注意这些环境特定的细节。 7. 示例代码的使用与迁移: - 学习者应该通过实践操作这些示例代码,以便更好地理解并行编程的原理和实践。 - 在不同HPC系统上使用这些示例时,需要考虑该系统的具体要求和限制,进行相应的代码调整和优化。 综上所述,该教学实例为学习者提供了一套完整的知识体系,涵盖了并行化编程、高性能计算系统使用以及具体环境配置等多个方面,旨在帮助学习者有效地掌握在HPC系统上进行高效并行计算的能力。