贝叶斯优化方法确定DFT-U参数的MATLAB源码介绍
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更新于2024-12-03
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资源摘要信息:"DFT的matlab源代码-BayesianOpt4dftu:贝叶斯Opt4dftu"
贝叶斯Opt4dftu是一个利用贝叶斯优化方法来确定DFT中的Hubbard U参数的Matlab源代码。在材料科学领域,第一性原理计算是一种重要的计算方式,其中DFT(密度泛函理论)是最常用的理论框架之一。DFT计算可以通过不同的交换相关泛函对材料的电子结构进行模拟。Hubbard U参数是在DFT+U方法中用于描述强关联电子系统中电子间相互作用的修正项,通过调整这个参数可以提高计算模型对某些材料电子结构的准确性。
在使用DFT+U方法时,如何选择合适的Hubbard U值是一个关键问题。贝叶斯优化方法能够结合先验知识和实验数据,通过迭代过程寻找到最佳的Hubbard U值。这种方法比传统的穷举搜索或随机搜索具有更高的效率和准确性。
为了运行贝叶斯Opt4dftu代码,用户需要具备以下环境配置:
- Python 3.6+
- NumPy库
- pandas库
- ASE(原子模拟环境)库
- 需要执行胃炎(可能是ASE库中的一个函数或模块)
- 贝叶斯优化库
代码依赖于维也纳从头开始仿真程序包(VASP),VASP是一个广泛使用的商用材料计算软件,用于计算材料的电子结构和性质。代码运行之前需要配置输入文件(通常名为input.json),该文件应包含以下部分:
- structure_info:包含目标材料的几何信息,例如晶格参数、晶格矢量、原子位置等。
- general_flags:包括VASP计算中需要的一般性标志。
- scf:在SCF(自洽场)计算中需要的特定标志。
- band:在能带结构计算中需要的特定标志。
- pbe:当使用PBE作为交换相关泛函时需要的标志。
- hse:当使用HSE06作为交换相关泛函时需要的标志。
安装代码包需要在命令行中运行:
```bash
python ./setup.py develop
```
运行代码前,需要更改环境变量VASP_RUN_COMMAND、OUTFILENAME和VASP_PP_PATH。之后,可以进入example目录,并运行example.py脚本来执行示例程序:
```bash
cd example/
python ./example.py
```
贝叶斯Opt4dftu项目的开源性意味着用户可以查看源代码、修改代码或将其用于其他目的,促进科学和工程计算的透明度和开放性。项目的开放代码库名称为BayesianOpt4dftu-master,表明这是一个主分支版本。
通过上述描述,可以了解到DFT+U方法、贝叶斯优化技术、以及它们在材料科学和计算化学领域的应用。同时,也涉及到一些计算机编程和软件操作的基础知识,如如何设置环境变量、如何配置和运行Python脚本以及如何使用ASE库与VASP软件进行交互计算。
2021-05-26 上传
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