生物信息学实践：PHP+MySQL实现在线答题系统

"这篇资料是樊龙江教授编写的《生物信息学札记（第3版）》的一部分，主要讨论初级序列数据的注释问题，特别是在PHP和MySQL环境下实现在线测试答题系统的实例。资料提到了几个重要的蛋白质结构数据库，包括PDB、NRL-3D、HSSP、SCOP和CATH，并且指出尽管序列注释格式在各数据库间存在差异，但注释内容大体相同。文中以EMBL数据库记录为例，解析了序列注释的代码和内容，并提及了生物信息学在基因组分析、分子进化和蛋白质结构预测等多个领域的应用。此外，资料还提到了随着高通量测序技术的发展，新增了关于小RNA分析和遗传多态性检测的内容。" 这篇文档主要涵盖了生物信息学的基础知识，特别是序列数据的注释和处理。序列注释是生物信息学的核心任务之一，它涉及到对DNA和蛋白质序列的解读和解释。在描述中提到，虽然不同的数据库如EMBL有不同的注释格式，但基本的注释信息是相通的，比如基因位置、功能描述、同源性信息等。作者以EMBL数据库的一个记录为例，演示了如何理解和解析这些注释代码。 文档还提到了几个关键的蛋白质结构数据库，这些数据库存储了大量的蛋白质结构信息，对于理解蛋白质功能和结构关系至关重要。PDB（蛋白质数据银行）是全球最大的蛋白质结构数据库，NRL-3D、HSSP、SCOP和CATH则分别提供了不同层次的蛋白质结构分类和比较信息。 此外，文档提及的PHP和MySQL实现的在线测试答题系统，可能是一个用于教学或自我评估的工具，让学习者能够测试和巩固他们在生物信息学概念和技术上的理解。这个系统利用Web技术，结合数据库管理，可以创建和管理各种生物学问题的题库，帮助用户进行交互式学习。 随着科技的进步，生物信息学的应用范围不断扩展，例如高通量测序技术的出现催生了对小RNA分析和遗传多态性检测的新需求。资料的后续版本加入了这两个章节，反映了生物信息学领域的最新进展。 这篇《生物信息学札记》不仅是对生物信息学基础知识的介绍，也是对这个快速发展的领域的动态追踪，对于学习和研究生物信息学的人员来说是一份宝贵的资源。