食管癌细胞中Fascin基因启动子的关键顺式元件鉴定
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更新于2024-09-06
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本文主要探讨了食管癌细胞中Fascin基因核心启动子区的关键顺式作用元件的鉴定。作者吴健谊、陆晓峰等人,针对食管癌这一重要的临床疾病,选取人食管癌细胞作为研究对象,采用生物信息学分析、嵌套缺失、定点突变和双荧光素酶报告基因等多种实验技术手段,系统地探究了Fascin基因在食管癌发生发展中的分子机制。
首先,他们观察了在三个食管癌细胞系(KYSE150、EC171和EC109)中,从5'端转录调控区的-2900位置逐渐缩短到-74位置时,Fascin基因启动子的转录活性变化。值得注意的是,不同细胞系表现出不同的趋势:在KYSE150细胞中,启动子活性随截短而逐渐降低,到-74位置下降约50%;然而在EC171和EC109中,尽管序列缩短,但启动子活性非但未降反升。这揭示了启动子区域的复杂调控可能因细胞类型差异而异。
进一步深入研究发现,当5'端转录调控区从-74缩短到-41时,Fascin基因在所有三种细胞中的转录活性几乎完全丧失,这表明该区域对于基因表达的调控至关重要。核心启动子区的精确位置被定位在-74/-41区间。
研究者着重关注了GCbox位点,这是发现的一个关键顺式作用元件,位于-70/-60区域。当与野生型GCbox位点的报告基因质粒相比,含有完全突变GCbox的质粒会导致荧光素酶活性显著下降约80%,显示出其对转录激活的决定性作用。而部分突变的GCbox也表现出类似的效果,强化了这个顺式作用元件的重要性。
总结来说,这项研究通过实验验证和生物信息学分析,揭示了在食管癌细胞中Fascin基因的核心启动子区及GCbox位点的调控作用,为进一步理解Fascin基因在食管癌的发生发展中所扮演的角色提供了重要的基础数据,对于食管癌的基因治疗和预防策略具有潜在的应用价值。
2021-09-25 上传
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