icoshift:快速对齐NMR光谱的MATLAB工具
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更新于2024-11-20
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资源摘要信息:"icoshift - 区间相关优化移位是一种在MATLAB环境中开发的开源工具,旨在处理和解决各类光谱数据集中的信号错位问题。该工具主要用于代谢组NMR数据分析中的信号对齐,但也可广泛应用于其他类似光谱数据集(如其他光谱方法数据或色谱数据)的处理。
icoshift的核心算法基于频谱间隔的相关移位,通过采用快速傅里叶变换(FFT)引擎来实现对所有频谱的同时对齐。与其他类似方法相比,icoshift算法显示出更高的速度性能,这使得即使是大型数据集的全分辨率对齐也成为可能,从而避免了进行下采样步骤(如分箱)的必要。此外,算法支持使用NaN(不是一个数字)作为填充值以避免在段边界处出现光谱伪影。
开发者提供了详细的帮助文档和使用示例,帮助用户更好地理解和应用icoshift工具处理真实的NMR数据集。对icoshift工具的使用将有助于提升数据处理的准确性和效率。
本工具的版本信息显示,存在两个可供下载的压缩包文件:icoshift_v1_3_1.zip和icoshift_v1_3.zip。用户应根据自己的需求选择适当的版本进行下载和安装。
关键词包括:icoshift,区间相关优化移位,MATLAB,信号对齐,NMR数据,光谱数据集,快速傅里叶变换(FFT),数据分析,代谢组学,频谱间隔相关移位,下采样,分箱,NaN(不是一个数字),光谱伪影。"
从标题和描述中可以提取以下知识点:
1. icoshift是一个专门针对代谢组NMR数据分析中的信号对齐问题而设计的MATLAB工具,但它的应用范围不仅限于NMR数据,也可用于处理其他光谱数据集。
2. icoshift算法通过频谱间隔的相关移位来对齐信号,是一种快速且有效的处理方式,尤其适用于大数据集的处理。
3. icoshift采用FFT引擎来同时对所有频谱进行对齐,这使得全分辨率的对齐成为可能,减少了下采样步骤的需要。
4. icoshift算法可以通过使用NaN作为填充值来避免段边界处的光谱伪影问题。
5. 用户在使用icoshift时可以获得详尽的帮助文档和处理NMR数据集的演示,这些资源有助于用户更有效地使用该工具。
6. icoshift的开发者引用了相关论文(F. Savorani, G. Tomasi, SB Engelsen; icoshift:一种用于快速对齐 1D NMR 光谱的多功能工具,J. Magn。 共振。 (2010)),这表明该工具的开发有着坚实的理论基础和实验验证。
7. icoshift工具提供了两个版本的压缩包文件供用户下载,用户应根据自身需求选择合适的版本。
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2021-10-16 上传
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