MCGH：Matlab工具箱实现DNA微阵列比较基因组杂交分析

CGH 技术能够通过基因组测量数千个基因的拷贝数变化，这在研究基因的扩增或缺失以及相关的染色体异常方面非常有用。M-CGH 工具箱提供了一个图形用户界面，使得用户可以方便地上传和处理数据，无需深入编程即可进行有效的数据分析。 该工具箱特别设计用于处理和可视化由微阵列图像分析软件（如 GenePix 和 QuantArray）导出的数据文件。这些文件包含了DNA微阵列实验的关键信息，包括探针的位置和强度信号，这些信号对应于特定基因的拷贝数变化。 通过M-CGH的图形界面，研究人员能够直观地观察到基因拷贝数的变化情况，包括那些扩增（增加的拷贝数）或缺失（减少的拷贝数）的区域。这对于快速识别基因组中的异常区域以及进一步研究基因功能和疾病关联非常重要。 此外，MCGH还提供了数据处理的自动化流程，提高了分析的效率和准确性。工具箱可能还包括数据预处理功能，如数据平滑、归一化处理，以及后续的数据分析步骤，比如统计分析和可视化展示，帮助研究人员更深入地理解实验结果。 值得一提的是，MCGH的开发强调了开放性和共享性，通过提供免费下载，使得广泛的科研社区能够使用先进的计算工具进行基因组数据分析。这不仅提高了研究效率，还促进了研究结果的可复现性。 综上所述，MCGH工具箱的发布与使用，为生物信息学和医学研究领域提供了一个有力的分析平台，有助于简化CGH实验的数据处理流程，加速基因组学研究的进展。" 资源链接:"http://www.biomedcentral.com/1471-2105/5/74"