电子病历分析:疾病修饰识别与命名实体关系抽取
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更新于2024-08-07
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"疾病和症状的修饰识别任务在电子病历命名实体识别中扮演关键角色,它涉及到识别疾病和症状的修饰成分,如当前的、否认、既往史等,这些修饰信息对于理解患者健康状况至关重要。这个任务是电子病历文本实体信息抽取中的独特研究领域。文章列举了多个研究实例,包括使用词典和规则的方法(如MedLEE和MedKAT),支持向量机(SVM)和条件随机场(CRF)等机器学习模型,以及结合半监督学习的方法。这些方法在不同的数据集上表现出不同的性能,最高F值可达0.9506。此外,文章还提到了电子病历的语料库和资源,如UMLS、SNOMED和I2B2评测数据,以及梅奥诊所的电子病历。"
本文主要探讨了电子病历(EMR)中的命名实体识别(NER)和实体关系抽取(ERE)的重要性。EMR作为临床治疗的产物,包含了丰富的医疗知识,其命名实体和关系的提取对于医疗信息抽取具有重大意义。文章首先分析了EMR的文本语言特性和结构特性,这些特性使得EMR的处理相对于其他文本更具挑战性。
在疾病和症状的修饰识别任务中,识别出如“无”这样的修饰词对于判断症状的存在与否至关重要。这个任务对于准确评估患者的健康状况和制定治疗方案有着直接影响。例如,"双侧眼球运动自如, 无眼震"中的“无”修饰了症状,表明患者没有眼震现象。
接着,文章回顾了多项NER和ERE的研究工作,涉及多种技术,包括基于词典和规则的方法,如MedLEE和MedKAT,它们依赖于预先定义的语法规则和资源如ICD-O和射线报告。另外,机器学习方法,如支持向量机(SVM)和条件随机场(CRF)被广泛应用于识别任务,如SVM和CRF结合SNOMED在梅奥诊所的电子病历上应用,取得了良好的效果。半监督学习和隐马尔可夫模型(HMM)也被用于提升识别性能,例如在I2B2 2010评测数据上的应用。
此外,文章还介绍了相关资源,包括共享的评测任务如I2B2,以及重要的医疗词汇资源UMLS和SNOMED,它们为研究提供了标准和基准。这些资源和评测任务推动了研究的进步,并促进了不同方法的比较和改进。
最后,文章指出,尽管已有显著进展,但该领域仍面临诸如数据标注的难度、领域知识的获取和利用、以及处理EMR复杂性的挑战。未来的研究方向可能包括更智能的机器学习模型、深度学习的应用、以及跨机构的标准化和互操作性。
疾病和症状的修饰识别是EMR信息抽取的关键组成部分,通过各种技术和方法,科研人员正在努力提高这一领域的准确性和效率,以更好地服务于医疗健康领域。
2022-02-09 上传
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jiyulishang
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