MPI并行编程:全散发收集(MPI_Alltoall)教程

需积分: 42 15 下载量 17 浏览量 更新于2024-08-19 收藏 4.02MB PPT 举报
"这篇资料是关于MPI并行编程的一个教程,特别关注了全散发收集(MPI_Alltoall)操作。MPI,即Message Passing Interface,是一种用于并行计算的标准接口,允许程序员在多处理器系统中通过消息传递进行进程间的通信。在这个教程中,提到了MPI_Scatter和MPI_Gather两个函数,它们分别用于数据的分散和收集。通过这些操作,可以在不同的进程间有效地分配和汇总数据。教程还包含了MPI的基础知识,点对点通信,聚合通信,数据类型,进程组与通信器,拓扑结构,以及并行I/O等内容。资料引用了几本关于并行计算和MPI的书籍,包括《并行计算导论》、《消息传递并行编程环境MPI》和《高性能计算之并行编程技术——MPI并行程序设计》。此外,教程还涵盖了并行计算的基础概念,如并行计算的目的,基本条件,以及不同类型的并行计算机体系结构,包括共享存储、非均匀访存、分布式存储和混合存储模型。" 在MPI并行编程中,全散发收集(MPI_Alltoall)是一个关键操作,它允许所有进程将数据发送到所有其他进程,并同时接收来自所有进程的数据。这在需要所有进程间交换数据的场景中非常有用,例如在全局数据重组或矩阵运算中。MPI_Scatter和MPI_Gather是另外两个重要的通信操作,前者将一个全局数组分散到多个进程中,后者则将多个进程的数据收集到一个进程中。 MPI的基础知识包括进程的概念,它们是并行计算的基本执行单元,通过消息传递来协同工作。点对点通信如MPI_Send和MPI_Recv允许单个进程向另一个进程发送和接收消息。聚合通信如MPI_Bcast(广播)、MPI_Reduce(归约)和MPI_Allreduce(全局归约)则是多个进程协同操作的高级通信模式。 数据类型在MPI中扮演着重要角色,因为它们定义了如何包装和传输不同类型的数据。进程组和通信器(MPI_Comm)是组织和管理进程集合的方式,允许在特定的进程集合中进行通信。拓扑结构则考虑了进程布局,如环形、二维网格等,这可以优化某些类型的通信操作。 并行I/O是并行计算中的另一个重要方面,特别是在处理大数据时,允许多个进程同时读写文件,提高效率。这个教程涵盖了并行计算的多个层面,从理论到实践,为理解和使用MPI提供了全面的指导。

请帮我修改这段代码的内存访问错误:#include <mpi.h> #include <stdlib.h> #include <stdio.h> int main(){ int rank, size; double starttime, endtime;//时间戳 int send_size=125;//125,1250,12500对应1kb、10kb、100kb信息 MPI_Init(0, 0); MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size); if (rank == 0) { // 初始化烫手山芋 char potato; potato=(char)malloc(send_sizesizeof(char));//分配内存空间 for(int i=0;i<send_size;i++){ potato[i]='a'; } // 发送烫手山芋给进程1 starttime = MPI_Wtime(); MPI_Send(&potato, send_size, MPI_CHAR, 1, 0, MPI_COMM_WORLD); printf("%f时,进程%d将烫手山芋发送给进程%d\n",starttime, rank, rank + 1); // 接收烫手山芋从最后一个进程 MPI_Recv(&potato, send_size, MPI_CHAR, size - 1, 0, MPI_COMM_WORLD, MPI_STATUS_IGNORE); endtime=MPI_Wtime(); printf("%f时,进程%d从进程%d接收到烫手山芋\n", endtime,rank, size - 1); free(potato); } else { // 接收烫手山芋从上一个进程 char potato; potato=(char)malloc(send_sizesizeof(char));//分配内存空间 MPI_Recv(&potato, send_size, MPI_CHAR, rank - 1, 0, MPI_COMM_WORLD, MPI_STATUS_IGNORE); endtime=MPI_Wtime(); printf("%f时,进程%d从进程%d接收到烫手山芋\n", endtime,rank, rank - 1); // 传递烫手山芋到下一个进程 starttime = MPI_Wtime(); MPI_Send(&potato, send_size, MPI_CHAR, (rank + 1) % size, 0, MPI_COMM_WORLD); printf("%f时,进程%d将烫手山芋传递给进程%d\n",starttime, rank, (rank + 1) % size); free(potato); } MPI_Finalize(); }

2023-06-10 上传

改进以下代码:#include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <mpi.h> #define N 4000 #define TAG 0 void merge(int arr[], int l, int m, int r) { int i, j, k; int n1 = m - l + 1; int n2 = r - m; int L[4000], R[4000]; for (i = 0; i < n1; i++) L[i] = arr[l + i]; for (j = 0; j < n2; j++) R[j] = arr[m + 1 + j]; i = 0; j = 0; k = l; while (i < n1 && j < n2) { if (L[i] <= R[j]) { arr[k] = L[i]; i++; } else { arr[k] = R[j]; j++; } k++; } while (i < n1) { arr[k] = L[i]; i++; k++; } while (j < n2) { arr[k] = R[j]; j++; k++; } } void mergeSort(int arr[], int l, int r) { if (l < r) { int m = l + (r - l) / 2; mergeSort(arr, l, m); mergeSort(arr, m + 1, r); merge(arr, l, m, r); } } int main(int argc, char** argv) { int rank, size; int i, j, k; int A[N], B[N]; int block_size, start, end; double start_time, end_time; MPI_Status status; MPI_Init(&argc, &argv); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size); MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); block_size = N / size; start = rank * block_size; end = start + block_size - 1; if (rank == size - 1) { end = N - 1; } if (rank == 0) { printf("Generating random array...\n"); for (i = 0; i < N; i++) { A[i] = rand() % 100000; } printf("Sorting array...\n"); } MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); start_time = MPI_Wtime(); MPI_Scatter(A, block_size, MPI_INT, &B[start], block_size, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD); mergeSort(B, start, end); for (i = 0; i < size; i++) { if (rank == i) { MPI_Send(&B[start], block_size, MPI_INT, (rank + 1) % size, TAG, MPI_COMM_WORLD); } else if (rank == (i + 1) % size) { MPI_Recv(&B[start], block_size, MPI_INT, i, TAG, MPI_COMM_WORLD, &status); } } MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); end_time = MPI_Wtime(); if (rank == 0) { printf("Writing result to file...\n"); FILE* fp; errno_t err; err = fopen_s(&fp, "sorted_array.txt", "w"); for (i = 0; i < N; i++) { fprintf(fp, "%d\n", B[i]); } fclose(fp); printf("Done!\n"); printf("Time used: %.6f seconds\n", end_time - start_time); } MPI_Finalize(); return 0; }

2023-05-30 上传