百万兆级计算机上的高性能原位分子动力学:突破与应用
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更新于2024-06-18
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本文档探讨了在百万兆级计算机平台上实现高性能、基于任务的原位分子动力学模拟的最新进展。作者埃斯特尔·迪兰德在格勒诺布尔阿尔卑斯大学的研究中,开发了一种创新的方法,将经典分子动力学算法与高并行性能的百万兆级计算机系统相结合,旨在提升计算效率和科学研究的实时性。
"原位系统"是指在模拟过程中,计算任务直接在数据所在的位置进行处理,无需频繁的数据传输,这在大规模分子模拟中尤为重要,因为数据传输通常会成为性能瓶颈。迪兰德的研究旨在通过任务并行化和优化算法设计,实现在这种复杂硬件环境中对大规模分子系统的高效模拟,从而减少计算延迟,提高整体性能。
论文的评审过程显示出其技术深度和广泛认可,评审团由多位来自不同领域的专家组成,如InriaGrenobleRhône-Alpes的研究总监布鲁诺·拉芬、CEADAM研究员洛朗·科隆贝特、以及来自国内外知名大学和研究机构的学者,他们对这一技术进行了严格的评估。评审团成员的背景涵盖了计算机科学、核能研究、数值计算等多个领域,表明了这项工作具有跨学科的重要性。
论文于2018年11月6日进行了公开答辩,并在同年获得了格勒诺布尔阿尔卑斯大学的博士学位。迪兰德在论文中表达了对导师Laurent Colombet和Bruno Raffin的支持,以及对父亲的敬意,他在艰难时期的支持对她的学术旅程至关重要。
这项研究对于高性能计算和分子动力学模拟领域具有重要意义,它不仅展示了如何充分利用高性能计算资源,还可能对未来科研和工业应用中的分子模拟技术产生深远影响,例如在材料科学、药物设计、生物物理等领域。随着百万兆级计算机的广泛应用,这种基于任务的原位分子动力学方法有望推动科学发现的前沿进程。
2020-01-01 上传
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