龙眼体胚发生过程的miRNA鉴定：Solexa测序揭示复杂调控网络

本文主要探讨了利用Solexa测序技术在龙眼（Dimocarpus longan）体胚发生过程中鉴定miRNA的详细研究过程。由林玉玲和赖钟雄两位研究人员主导，他们的研究得到了国家自然科学基金（31078717）以及高等学校博士学科点专项科研基金（20093515110005）的支持。Solexa测序技术在此研究中扮演了关键角色，它是一种高通量测序方法，能够揭示大量个体小分子RNA，如microRNA (miRNA)，这些非编码RNA在植物的生长发育和对逆境的响应中发挥着调控作用。 论文的焦点在于填补了关于植物体胚中miRNA研究的空白。通过对龙眼体胚建立小RNA文库，并运用Solexa测序技术进行深度分析，研究者发现了6,553,782条独特的序列，其中只有13,151条与已知miRNA相似，显示出体胚中miRNA的多样性。研究结果显示，miRNA在体胚发生过程中表现出显著的表达差异，从极低丰度到数万个拷贝不等，这可能反映了它们在不同发育阶段的动态调控作用。 值得注意的是，研究中鉴定出了367个已知的柑橘miRNA家族，这些家族间的成员数量差异大，显示了miRNA家族在功能和进化上的异质性。此外，研究人员还发现了23个潜在的新miRNA候选者，其中10个含有单个基因座，而另外13个则具有多个基因座，这表明了miRNA的复杂性和可能的功能多样性。进一步的分析发现，69个候选miRNA预测到了大约70个基因作为靶基因，这些靶基因可能参与到龙眼体胚发育的关键生理过程中。 关键词“龙眼”、“体细胞胚胎发生”、“miRNA”和“Solexa测序”强调了研究的主题和方法，突显了这项工作在龙眼个体发育研究中的重要性和创新性。这篇首发论文不仅提供了龙眼体胚miRNA表达的新数据，还为理解植物胚胎发育过程中的miRNA调控机制提供了宝贵的洞见。