详解CINEB方法下的VASP过渡态计算步骤与VTST CI-NEB应用
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更新于2024-08-29
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过渡态计算是材料科学和化学领域的重要课题,特别是在使用VASP软件时,理解并掌握CINEB方法的实施步骤至关重要。CINEB全称为Car–Parrinello NEB(Nudged Elastic Band),这是一种在反应途径上寻找过渡态(Transition State,TS)的高效算法。过渡态是一阶鞍点,能量高于反应路径上的其他点,它标志着旧键断裂和新键形成之间的平衡点,是反应进行的关键控制点。
在进行CINEB计算前,首先需要确保已经安装了VTST模块,因为VTST中的CI-NEB方法更为适合这种复杂的搜索。准备工作包括优化初始状态(反应物)和最终状态(产物)的结构,这一步非常重要,因为它确定了计算的起点和终点,需要提供CONTCAR和OUTCAR文件作为输入,并且建议分别将这两个阶段的文件夹命名为代表性的ini(初始)和fin(最终)。
接下来,通过VTST脚本dist.pl来评估两个优化后的结构之间的相似性,通常以每个原子初末状态间的平均距离(欧氏距离)为标准,小于5埃被认为是合适的。根据这个返回值,决定插点的数量,通常插点数N取dist.pl值除以0.8左右,确保插点数目能够被处理器核数整除,以提高计算效率,特别是当节点数多于8个时,建议使用至少两个节点以上。
在插点设置完成后,将ini和fin的OUTCAR文件复制到对应的节点中,便于后续分析。此时,需要准备与初末态计算相同的KPOINTS和POTCAR文件,但INCAR文件需要调整为过渡态计算所需的特殊参数,如EDIFF=1E-7,这是一个关键参数,因为它直接影响到过渡态搜索过程中力的计算精度,需要极高的数值控制。
INCAR中的非过渡态参数应保持与初末结构优化一致,这是为了保证计算的一致性和可靠性。通过这些步骤,CINEB方法能够在VASP环境中有效地搜索和优化过渡态,揭示反应路径中的能垒信息,从而帮助科学家们理解化学反应的动力学性质,优化设计催化剂或材料性能。
2021-09-27 上传
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