基于插值拟合的IVFC信号细胞计数方法应对基线漂移
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更新于2024-08-28
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在生物医学研究领域,体内流式细胞术(In Vivo Flow Cytometry, IVFC)作为一种关键的技术,允许研究人员实时监测活体动物体内的目标细胞动态变化。然而,尽管IVFC系统的构建已经相当成熟,但一个普遍存在的挑战是基线漂移(baseline drift),这会对细胞计数的准确性产生显著影响。传统的方法,例如动态峰选择法,通常通过设定固定的阈值来识别细胞信号,但这忽视了基线漂移的影响,导致细胞计数结果的偏差。
本文由Xiaoling Wang、Yuanzhen Suo、Dan Wei、Hao He等人合作撰写,他们来自上海交通大学的Med-X研究 institute和生物医学工程学院,以及上海交通大学的船舶海洋与建筑工程学院。他们针对IVFC数据中的基线漂移问题,提出了一种新的细胞计数方法。这种方法利用插值拟合技术,能够动态地适应信号的变化,而不是简单地依赖静态阈值。通过自动分割和处理,该算法能够有效地捕捉到细胞信号的峰值,同时修正由于基线漂移引起的计数误差。
该方法首先对IVFC信号进行预处理,包括噪声滤波和基线平滑,以减少干扰因素。接着,采用数值插值的方法估计基线漂移的模型,这一步对于准确跟踪信号的动态变化至关重要。在插值过程中,算法会考虑到信号的时间连续性和趋势,从而更精确地定位细胞事件。然后,基于这些信息,算法能够实时更新阈值,确保在基线变动时也能正确识别细胞信号。
相比于传统的动态峰挑选法,这种新的细胞计数方法提高了计数的精度,尤其是在处理长时间或频繁基线漂移的情况下。这对于长期实验或疾病进展监控等研究来说,具有重要的实际应用价值。通过改进IVFC数据分析的鲁棒性,该研究有助于提升体内细胞动态监测研究的信度,从而推动生物医学领域的进一步发展。最后,该成果于2017年3月20日发表,为生物医学研究者提供了一种有效解决IVFC数据处理中基线漂移问题的新工具。
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