FASTA格式：生物信息学中的序列表示法

"FASTA格式是生物学领域广泛使用的序列格式，用于存储DNA或蛋白质序列信息。它由一个描述行（以'>'字符开始）和随后的序列数据行组成。描述行通常包含序列的标识符，如基因标识符或数据库引用，而后续的行则包含序列本身，每行不超过80个字符。FASTA格式简洁易处理，适用于各种编程语言进行操作，如Python、Ruby和Perl。这种格式的历史可以追溯到FASTA软件，现在已成为生物信息学的标准。FASTA文件中的序列可以通过标识符区分，且序列数据可以进行压缩和扩展。" FASTA格式是一种在生物信息学中至关重要的序列表示方式，它允许科学家们方便地存储、交换和分析生物序列数据。该格式的设计使得序列数据易于处理，无论是手动还是通过计算机程序。在FASTA文件中，每个序列由一个起始行（以'>'符号开头）开始，这一行被称为描述行，通常包含序列的唯一标识符，比如GI号（GenBank Identifier）或者数据库中的参考编号，同时也可以包含关于序列的一些描述性文本。 描述行后的连续行是序列的实际数据，这些行以换行符分隔，以保持行长度适中，一般不超过80个字符，这是为了兼容早期的终端设备显示限制。对于较长的序列，它们会被拆分成多行，但是处理时，这些行会被视为一个连续的序列。 FASTA格式不仅限于纯文本文件，还可以与压缩技术结合，如gzip，以减少文件大小，这对于处理大量序列数据尤其有用。此外，该格式还支持扩展，例如，可以添加额外的元数据或注释信息，这些信息可以包含关于序列来源、实验条件或其他生物学相关属性的详细描述。 在实际应用中，FASTA格式被广泛应用于基因组学、蛋白质组学以及生物医学研究的各个领域。它被各种生物信息学工具和软件所采纳，如BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）进行序列比对，或者用于构建进化树、预测蛋白质结构和功能等。由于其简单性和通用性，FASTA格式已经成为生物序列数据交换的事实标准。