掌握R语言接口,轻松保存研究数据至Zenodo
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更新于2024-12-24
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资源摘要信息:"zenodo:将数据(或任何研究对象)存入 Zenodo"
Zenodo 是一个开放的科学数据存储库,位于瑞士的 CERN。 Zenodo 旨在促进研究人员以任何规模、任何格式和任何科学共享和保存任何研究成果。 Zenodo 还为研究人员提供了创建数字对象标识符(DOI)的能力,以确保研究成果的持久性和可引用性。
Zenodo 的 R 接口提供了研究人员通过 R 语言与 Zenodo 进行交互的能力。R 是一种广泛用于统计分析和图形表示的编程语言,特别是在数据科学和统计学领域。
芝诺多(Zenodo)的具体操作流程如下:
1. 注册:用户首先需要在 Zenodo 官网上注册一个账户,这是使用 Zenodo 存储库的第一步。
2. 登录并访问个人资料:注册完成后,用户需要登录 Zenodo,访问并管理自己的个人资料。
3. 获取个人访问令牌:在个人资料页面中,用户需要单击“个人访问令牌”并获取一个个人访问令牌。这个令牌是用户与 Zenodo API 进行交互的凭证。
4. 在 .rprofile 文件中添加个人访问令牌:用户需要将个人访问令牌添加到 R 的配置文件 .rprofile 中。这样做可以避免在每次函数调用时都需要显式传递令牌,但同时,公开令牌可能会危及用户的账户安全。因此,也可以选择每次函数调用时显式传递。
5. 安装 rzenodo 包:通过 R 的包管理工具 devtools,用户需要安装 rzenodo 包。该包提供了一系列函数,以编程方式与 Zenodo 进行交互。
Zenodo 包含以下功能:
- zenodo_dir():该函数提供一个数据框(data.frame),其中包含了当前 Zenodo 集合列表的信息。这允许用户通过 R 查看和分析 Zenodo 存储库中的数据集。
利用 Zenodo 的 R 接口,研究人员可以自动化数据上传、管理和检索过程,从而提高工作效率并促进数据共享和协作。它为数据分析人员提供了一种便捷的方式来发布和引用数据集,为科学研究的开放性和可重复性做出了贡献。
通过这种方式,研究人员能够确保他们的数据在研究完成后得到妥善保存和公开分享,同时也能够为自己的研究工作获得学术认可。Zenodo 和 rzenodo 包的结合使用为使用 R 语言的研究人员提供了一个强大的工具集,以符合开放科学的最佳实践。
此外,zenodo-master 文件名可能指的是包含上述 rzenodo 包源代码或安装脚本的压缩文件。这表明开发人员可能需要安装包含在 zenodo-master 压缩文件中的软件包,以便与 Zenodo 进行集成和交互。
2021-05-16 上传
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