CP2K 4.x-5.x 多进程并行安装教程:Intel编译器与MPI并行库
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更新于2024-09-09
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"这篇教程详细介绍了如何安装CP2K 4.x-5.x的多进程并行版(host.popt版本),适用于量子力学和分子动力学计算。教程强调使用Intel编译器,特别是2015年及以后的版本,因为早期版本可能会导致编译错误。同时,GCC编译器需支持C++11标准,至少为4.8.1版本,否则可能安装失败。非root用户可以安装,但受限于权限,只能在个人主目录下进行,无法执行需要root权限的操作。教程中提到了安装路径、环境变量设置以及依赖软件的下载地址。"
在这篇详细的CP2K安装教程中,首先要注意的是它专注于使用Intel编译器,因为该编译器包含了必要的MPI并行库和MKL数学库,这对于CP2K的高性能计算至关重要。教程中指出,必须使用2015年或更新的Intel编译器版本,以避免可能的编译错误。同时,GCC编译器的版本不应低于4.8.1,因为这是支持C++11标准的最低要求。如果当前系统中安装的GCC版本不符合要求,教程建议升级到5.2.0版本。
安装过程在root权限下进行,这意味着可以全局安装和配置CP2K,包括添加环境变量到系统级别的配置文件`/etc/profile`。安装完成后,需要在文件末尾添加相应的Intel编译器和MKL库的路径,以便系统能够正确识别和使用这些组件。
安装CP2K时,选择的是`Linux-x86-64-intel-host.popt`版本,但具体配置更改是在`Linux-x86-64-intel-mic.psmp`文件中进行的。安装过程中,还需要参考官方文档和安装包内的提示来操作。
此外,教程还提供了额外软件包的下载链接,这些软件包通常可以从CP2K官网获取,但可能不是最新的版本。作者建议将所有软件安装在非根目录下,例如`/opt/`目录,避免在`/home/`目录及其子目录中安装,因为这可能导致权限问题。
对于那些不需要配置阶段即可直接`make`的软件,可以直接将安装文件复制到指定的安装目录,如`/opt/`。整个安装过程需要细心操作,确保所有依赖项已满足,环境变量设置正确,以确保CP2K能正常运行并充分利用多进程并行计算能力,这对于大型的量子力学和分子动力学模拟至关重要。
2021-02-25 上传
2021-05-26 上传
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天堂苏
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