PyTorch实现的无监督医学图像分割技术

是一项专注于使用无监督学习技术进行医学图像分割的研究项目。该代码库通过使用PyTorch框架,提供了医学图像无监督分割的实现方法。在这个过程中,开发者可以通过对比配准技术,无需标注数据即可对医学图像进行分割。
该项目的作者包括刘立豪,当归I阿维莱斯·里维罗和卡罗拉·比比亚恩·舍恩利布,他们共同贡献了这一研究工作。项目提供的PyTorch实现是目前在医学图像处理领域内无监督学习方法的研究热点,特别是在处理缺乏大量标注数据的情况下,能够显著提高图像分割的准确度和效率。
代码库使用了以下关键库版本要求:
- PyTorch 1.5.0:一个广泛使用的深度学习框架,它提供了灵活性和效率,广泛应用于计算机视觉和自然语言处理领域。
- PyTorch Vision 0.4.2:PyTorch的视觉处理库,为处理图像提供了便捷的工具和数据加载器。
- SimpleITK 1.2.4:一个简化了的ITK(Insight Segmentation and Registration Toolkit)接口,专注于提供易于使用的图像分析功能。
- opencv-python *.*.*.**:一个开源的计算机视觉和机器学习软件库,它包含了大量的计算机视觉算法。
在安装和使用该代码之前,用户需要按照以下步骤操作:
1. 克隆存储库:
- 使用命令`git clone ***`从GitHub上克隆项目到本地。
- 进入克隆好的项目文件夹:`cd unsupervised-medical-image-segmentation`。
2. 下载LPBA40数据集:
- LPBA40数据集包括图像和分割蒙版,可以通过特定的链接获取。
- 将下载好的LPBA40数据集中的图像(LPBA40图片)和分割蒙版(LPBA40标签)解压缩到`datasets/LPBA40`文件夹内。
数据集LPBA40是一个用于测试和验证的常用基准数据集,在神经影像学研究领域内具有一定的知名度,它包含了40个经过预处理的大脑MRI扫描图像和相应的分割标签。
在研究和使用“无监督医学图像分割的对比配准”代码时,开发者和研究人员需要对无监督学习方法有一定的了解,以及对深度学习和PyTorch框架有一定的掌握。此外,理解医学图像的特点和分割任务的相关知识也是必要的。通过该代码实现的无监督分割技术,可以在标注数据有限的条件下,自动识别图像中的不同结构和区域,为疾病的早期诊断和治疗提供重要的参考信息。
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2021-07-06 上传
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信徒阿布
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