Unix/Linux操作系统指南:磁盘与系统管理
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更新于2024-08-08
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"该资源是一本关于生物信息学实用技术的书籍,主要针对Unix/Linux操作系统,涵盖磁盘及系统管理、软件安装、数据处理、序列比对、基因组注释和SNP分析等内容。书中详细介绍了各种常用的生物数据分析工具和命令行工具的使用方法,如df和du命令用于磁盘空间管理,Clustalw和MUSCLE进行序列比对,以及RepeatMasker和tRNAScan进行基因组分析。"
在《磁盘及系统管理-i.mx_virtualization_user's_guide》这一章节中,主要讨论了两个关键的Linux命令行工具:df和du,它们对于监控和管理计算机的磁盘空间至关重要。
1. **df命令**:
- df是“disk free”的缩写,用于查看文件系统的磁盘空间使用情况。
- 通过运行`df`,用户可以获取所有挂载的文件系统的总空间、已用空间、可用空间和使用率等信息。
- 常用参数:
- `-a`:显示所有文件系统,包括系统的临时文件系统。
- `-k`:以千字节(KB)为单位显示磁盘空间。
- `-i`:显示inode信息,即文件系统中的数据节点使用情况。
- `-t`:只显示指定类型的文件系统,如ext4、fat32等。
- `-x`:排除指定类型的文件系统。
- `-T`:显示文件系统的类型。
2. **du命令**:
- du是“disk usage”的缩写,用于统计目录或文件所占用的磁盘空间。
- `du [目录或文件名]`,默认对当前目录进行统计。
- 常用参数:
- `-h`:以人类可读的格式(如K、M、G)显示结果。
- `-s`:仅显示总计,即指定目录的大小。
- `-a`:显示所有文件和子目录的大小。
这些基础的磁盘管理命令对于系统管理员和生物信息学家来说非常有用,因为它们可以帮助优化存储空间,确保系统正常运行,并有效地处理大量生物数据。
除了磁盘管理,书中还涉及了Unix/Linux操作系统的其他方面,如文件操作、文本处理、权限管理、软件安装等,这些都是进行生物信息学分析的基础。同时,书中还涵盖了多种生物数据处理软件,如测序原理、序列比对、基因组注释和SNP分析,这些都是生物信息学研究的关键技术。例如,Clustalw和MUSCLE用于全局序列比对,Blast和blat用于局部比对,而RepeatMasker则用于识别和分析基因组中的重复序列。这些工具的详细介绍有助于读者理解和应用到实际的生物信息学研究中。
2019-07-31 上传
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MichaelTu
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