PCA实现:MATLAB代码归一化与主成分计算
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更新于2024-11-11
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该资源是一组关于在MATLAB中实现主成分分析(PCA)的代码,包括三个函数:`pcamain.m`、`pcastd.m` 和 `pcafac.m`。`pcamain.m`是主程序,负责读取数据文件,对数据进行归一化处理,并计算主成分;`pcastd.m`实现数据的标准化;`pcafac.m`用于计算协方差矩阵、特征值和特征向量,并确定保留的主成分数量。
主成分分析(PCA)是一种统计方法,通过线性变换将原始高维数据转换为一组线性不相关的低维变量,称为主成分。这些主成分保留了原始数据的大部分信息,且彼此之间互不相关,有助于降低数据复杂性,用于数据分析、数据可视化或特征提取。
在`pcamain.m`中:
1. 函数`pcamain`接受三个参数,`filename`是数据文件名,`a`和`b`是数据的维度信息。
2. 使用`fscanf`函数读取数据文件,并存储到`vector`矩阵中。
3. 调用`pcastd`函数对数据进行标准化处理。
4. 之后调用`pcafac`计算主成分,其中包括计算协方差矩阵和特征值、特征向量。
5. 使用`pcascore`函数计算每个样本在新主成分空间的得分。
在`pcastd.m`中:
1. `pcastd`函数接收一个二维矩阵`vector`,并计算每列的均值,然后将每个元素除以其所在列的均值,完成数据的标准化。
在`pcafac.m`中:
1. 计算数据的协方差矩阵`std`,这反映了变量之间的相关性。
2. 使用`eig`函数计算协方差矩阵的特征值和特征向量。
3. 对特征值按降序排列,选取累计贡献率超过85%的特征向量,这部分决定了保留的主成分数量。
4. 计算保留主成分的新矩阵`result`,每个元素为原特征向量乘以对应的平方根特征值。
在`pcascore.m`中:
1. `pcascore`函数计算原始数据在主成分空间的得分,即每个样本在新坐标系下的坐标表示。
通过这些函数,用户可以在MATLAB环境中实现完整的主成分分析过程,从数据预处理到主成分计算,再到最终的得分计算,有效地降低了数据的维度并保持其主要信息。
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