中南大学Gaussian计算实战:乙烯结构优化与设置详解
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更新于2024-07-23
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Gaussian计算实例是一篇关于如何在中南大学高性能计算平台上利用Gaussian 03软件进行第一性原理计算的实际教程。Gaussian是一款广泛应用于量子化学领域的计算程序,它支持从分子结构优化到反应路径预测等多种计算任务。在这篇文章中,作者何永辉以计算优化乙烯结构为例,详细介绍了使用Gaussian的过程。
首先,用户需在GaussView 3.07环境中操作,这是一个图形用户界面工具,可以方便地创建和编辑分子模型。通过File > New > CreateMolGroup,打开新窗口,选择CarbonTrigvalent(S-S-D)来添加碳元素,并通过点击碳碳双键按钮构建乙烯分子。用户需注意设置分子的连接方式和几何构型。
在计算设置方面,选择"optimization"作为工作类别,意味着要进行分子结构的优化,以找到能量最低的状态。Gaussian使用DFT方法(密度泛函理论),其中选择了非限制性(Unrestricted)选项,因为乙烯分子中有α和β电子。B3LYP是一种常用的交换-相关函数,提供了较好的平衡准确性和计算效率。
选择6-31G作为基础函数集,这是一种常见的原子轨道基组,包括非关联部分和极化及弥散函数。对于中性分子,分子电荷被设为0,自旋多重度设为singlet,意味着分子内无未成对电子。
在设置完成后,用户会保存输入文件并启动Gaussian计算。这个过程可能需要高性能计算平台的资源,因为第一性原理计算通常涉及大量的矩阵运算和复杂的数值求解,对计算能力有较高要求。在中南大学高性能计算平台上,用户可以享受到高效并行处理的优势,加速计算过程。
通过这篇文章,读者不仅可以学习到如何在Gaussian中操作,还可以了解如何在实际科研项目中合理配置计算参数,充分利用高性能计算资源。这对于化学、材料科学以及相关领域的研究人员来说,是一份实用的参考材料。
2019-04-12 上传
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daotanliu
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