Matlab源代码:PBCDFT在Pyscf晶体DFT基准中的应用
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更新于2024-12-24
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资源摘要信息: "DFT的matlab源代码-pbcdft_pyscf_benchmarks:Pyscf的各种晶体的PBC/DFT基准文件"
知识点概述:
1. 密度泛函理论(Density Functional Theory, DFT)源代码:本资源包提供了使用MATLAB编写的密度泛函理论(DFT)计算的源代码,用于晶体结构的电子结构计算。
2. PySCF库:PySCF是一个开源的Python化学仿真软件包,用于计算量子化学,特别是在固体、分子和化学反应等领域。
3. 周期性边界条件(Periodic Boundary Conditions, PBC):在计算材料科学中,周期性边界条件是模拟无限周期晶体结构的一种方法,以减少有限体系尺寸的影响。
4. 基准测试文件:这些文件提供了用于测试和验证不同材料和原子基础集的DFT计算结果的参考标准。
详细知识点解析:
1. 晶体PBC/DFT计算:晶体的PBC计算是利用周期性边界条件来模拟晶体内部无限重复的结构单元。这种计算方法对于研究固体物理和材料科学特别重要。DFT则是通过密度泛函理论提供一种计算电子结构的有效方法,这种方法可以用于预测材料的电子性质,如能带结构、电荷密度分布等。
2. PySCF开发人员版本:提供的PySCF版本是具有特定修订号712e40e23e7a7c928f2e0c27498b3fa5f122454b的开发人员版本,这意味着这是一个特殊的版本,可能包含了最新的更新或修复。
3. 参数设置与计算细节:
- cell.basis 设置:'gth-dzvp' 指定了使用Gaussian和Type(GTH)类型的赝势以及DZVP(双ζ价极化)基组。
- cell.pseudo 设置:'gth-pade' 指定使用GTH类型的赝势。
- mf.newton():调用牛顿方法进行自洽场(SCF)的优化。
- mf.xc:设置交换关联泛函为'lda',即局域密度近似。
- mf.direct_scf:设置为真,意味着使用直接SCF算法,这通常能加快计算速度。
4. 基础集的添加:本基准测试包需要在系统路径中添加一些原子基础集,具体位于/home/jyu5/pyscf/pyscf/pbc/gto/basis目录下。这些基础集用于计算不同原子和分子的电子结构。
5. 系统开源:这意味着PySCF软件包和相关基准测试文件都是开源软件,允许用户自由下载、使用、修改和重新分发代码,从而促进科学合作和知识共享。
6. 压缩包文件名称列表:提供的压缩包文件名称为"pbcdft_pyscf_benchmarks-master",这表明资源包遵循了版本控制系统(如Git)中的主分支命名规则,表示主干版本。
总结:
本资源为晶体材料研究者提供了一套基于DFT和MATLAB源代码的计算基准文件,结合PySCF开源化学仿真软件包。这些文件具有完整的参数设置和计算细节说明,适合在周期性边界条件下进行固体的电子结构计算。资源的开源特性不仅为材料科学的学术研究提供了便利,也促进了学术界对软件代码的共同改进和完善。
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