SPM5全方位操作指南：从时空处理到校正解扭曲

"SPM5使用手册" SPM5（Statistical Parametric Mapping 5）是用于处理和分析神经影像数据的软件工具，主要应用于功能性磁共振成像（fMRI）、结构磁共振成像（sMRI）等研究。该手册由The FIL Methods Group编写，由Wellcome Trust Centre for Neuroimaging下属的功能性成像实验室发布，位于伦敦大学学院的神经科学研究所。 手册详细介绍了SPM5的各个操作步骤，包括时间域处理和空间域处理两个主要部分，旨在帮助用户理解和执行数据分析任务。 **一、时间域处理** 时间域处理主要涉及切片时间校正（Slice Timing），目的是解决由于MRI扫描仪在不同时间获取不同切片导致的时间对齐问题。手册中详细解释了以下参数： 1. **Session**：指的是MRI扫描的一个完整周期，通常包含多个时间点（或称为时间序列）。 2. **Number of Slices**：扫描的切片总数，每个切片代表大脑的一个横截面。 3. **TR (Repetition Time)**：两次连续激发之间的时间间隔，即一个完整扫描周期的时间。 4. **TA (Acquisition Time)**：采集一个切片所需的时间。 5. **Slice order**：切片的扫描顺序，可能有多种模式，如连续、交替等。 6. **Reference Slice**：用于参考的时间点，用于调整其他切片的时间对齐。 **二、空间处理** 空间处理主要包括图像配准（Realign）、去扭曲（Unwarp）等步骤，以实现图像的空间标准化和校正。 1. **Realign：Estimate** 阶段，是对扫描图像进行运动校正的估计过程，通过对数据进行分析来确定图像之间的位移。 2. **Realign：Reslice** 阶段，基于估计的运动参数将图像重新采样到新的坐标系中，以消除运动引起的失真。 3. **Realign：Estimate & Reslice** 结合了估计和重采样步骤，同时考虑了运动参数和重采样选项。 此外，手册还提到了**Realign & Unwarp** 部分，这是对由于受试者呼吸和心跳引起的大脑变形进行校正的步骤。这一部分包含了数据和估计选项，特别是质量控制，确保校正的准确性和可靠性。 SPM5手册通过这些详细的章节，为用户提供了从数据预处理到统计分析的全面指导，对于理解和应用SPM5进行神经影像学分析至关重要。它不仅涵盖了基本操作，还讨论了高级功能，如不同的估计和重采样选项，有助于用户根据研究需求定制分析流程。