云南虫生真菌粉棒束孢遗传多样性与分化研究
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更新于2024-07-16
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云南虫生真菌粉棒束孢遗传分化研究,由代永东、虞泓等人进行,主要针对云南当地的粉棒束孢和蝙蝠蛾拟青霉进行了深入的遗传学分析。该研究采用了一种综合的方法,包括对ITS序列的测序和RAPD扩增技术,以及与GenBank数据库中的相关序列对比,旨在探讨粉棒束孢的遗传多样性、居群遗传结构以及种内分化。
首先,研究人员对中国云南的8个粉棒束孢当地居群和2个蝙蝠蛾拟青霉居群进行了详细的遗传学分析。通过测定大量ITS序列,共得到97条单倍型,计算出的单倍型多样性和总核苷酸多样性分别为Hd=0.546和Pi=0.00276,这显示出粉棒束孢在物种水平上的遗传多样性相对较低。然而,当将焦点集中在云南地区时,发现了显著的差异。云南粉棒束孢的37条序列被分类为14种单倍型,其中10种为本地特有的,显示出更高的单倍型多样性和核苷酸多样性(Hd=0.659,Pi=0.00274)。单倍型聚类和网状分支分析揭示了云南地区的粉棒束孢遗传多样性高且单倍型类型丰富,支持云南可能是粉棒束孢多样性的重要分布中心。
遗传分化方面,研究发现云南8个居群之间的遗传分化系数Fst为51.95%,而RAPD电泳图谱分析则显示Gst值为0.5547,基因流Nm为0.4014,这些数据均表明云南居群间的分化程度相当高。进一步的地理距离与遗传距离相关性研究并未显示出明显的正相关,暗示粉棒束孢的遗传差异可能并非单纯由地理因素驱动。
中性检验和失配分析结果显示粉棒束孢经历过近期的居群扩张,这可能影响了其遗传格局的变化。在单倍型聚类和网状分支分析中,发现Hap19可能是扩张建群单倍型,尽管原始祖先单倍型(Hap1)依然占据优势地位,频率高达48.45%。这表明粉棒束孢的遗传分化并不完全由地理隔离导致,而是原始单倍型和衍生类群共同存在并影响了其遗传格局。
该研究揭示了云南粉棒束孢复杂的遗传特性,包括低物种水平的遗传多样性,但在特定区域如云南具有较高的局部多样性,且遗传分化受到历史事件如居群扩张的影响。这一研究对于理解粉棒束孢的生物学适应性、种群动态以及保护具有重要的科学价值。
2020-01-04 上传
2023-05-30 上传
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2023-06-10 上传
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