实验验证的lncRNA-染色质相互作用资源：LnChrom在人类和小鼠中的应用

" LnChrom 是一个人类和小鼠实验验证的长非编码RNA(lncRNA)与染色质相互作用的资源库。" 长非编码RNA（lncRNA）是长度超过200个核苷酸但缺乏明显的蛋白质编码能力的RNA分子。尽管它们不编码蛋白质，但lncRNA在基因调控、染色质重塑、细胞分化等多个生物学过程中发挥着关键作用。然而，由于其功能复杂且研究相对较少，lncRNA与染色质的交互作用在很大程度上仍然是未知的。 LnChrom数据库提供了一个全面的平台，专门用于存储和分析这些实验验证的lncRNA与染色质相互作用数据。这个数据库包含的数据来自人类和小鼠，这两种模式生物在生命科学研究中具有广泛的应用。用户可以利用该资源来探索特定lncRNA如何影响基因表达，以及它们如何参与染色质结构的改变。 数据库工具如LnChrom对于理解基因表达的精细调控至关重要，因为lncRNA可以通过多种机制与染色质相互作用，例如通过绑定到DNA、RNA或者染色质修饰蛋白，从而影响基因的转录活性。这些相互作用可能涉及启动子区域、增强子、绝缘子等关键遗传元件，进而影响基因表达的时空特异性。 在LnChrom中，用户可以搜索并获取lncRNA与特定染色质区域的相互作用信息，包括但不限于lncRNA的名称、序列、位置、与染色质的结合模式以及相关功能注释。此外，数据库可能还提供了交互作用的验证方法，如ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序）或RNA-seq数据，以及这些数据的可视化工具，以便研究人员进行深入分析。 这个资源对于lncRNA研究领域的科学家来说非常宝贵，它可以帮助他们发现新的lncRNA功能，揭示潜在的疾病关联，并为开发新的治疗策略提供线索。同时，由于lncRNA与染色质相互作用可能与多种疾病，特别是癌症的发生发展有关，因此， LnChrom对于临床研究和转化医学也具有重要意义。 LnChrom数据库为lncRNA研究提供了宝贵的实验数据集，促进了对lncRNA介导的染色质调控的理解，对于增进我们对基因表达调控网络的认识，以及探索生物体复杂生理和病理过程背后的分子机制有着重大贡献。