克隆与分析猪ITGB1BP2基因启动子：发现关键顺式元件和转录因子位点

猪ITGB1BP2基因启动子的克隆与分析是一项重要的研究，由张子见、刘敏和熊远合作完成，得到了徐德全教授的支持，论文发表在中国科技论文在线。研究的目的是深入理解ITGB1BP2基因的功能调控机制，特别是它的启动子区域，这对于动物遗传育种与繁殖领域具有潜在的应用价值。 该研究采用了一种系统的方法。首先，通过特异引物ITGB1BPF和ITGB1BPR从猪基因组DNA中高效地扩增出ITGB1BP2基因的5'侧翼片段，这是一种关键的步骤，因为启动子通常位于基因的5'端，对基因表达起着决定性的作用。扩增后的片段随后通过T/A克隆技术进行克隆，这是一种常用的PCR产物纯化和克隆的方法，以便获得多个拷贝的完整启动子序列。 克隆得到的ITGB1BP2基因的5'侧翼DNA序列长达1442bp，这包含了启动子区域，显示了丰富的启动子特征元件，这些元件对于基因转录的启动至关重要。研究者还进行了深入的生物信息学分析，利用了诸如NNPP（Non-repetitive DNA Position Program）、MotifFinder、TFSEARCH（Transcription Factor Search）、SignalScan和CPGPLOT等工具，来识别和解析顺式作用元件（cis-regulatory elements）和转录因子结合位点（transcription factor binding sites）。顺式作用元件可以调节基因表达的开启或关闭，而转录因子是调控这些过程的关键蛋白质，它们识别并结合到启动子上的特定序列上，从而影响RNA聚合酶的结合和转录活动。 论文的作者张子见是一位在读硕士研究生，他的研究方向集中在分子生物学与动物育种，表明这项工作是他在学术道路上的重要贡献。此外，徐德全副教授作为通信联系人，专注于动物功能基因组学与育种，他的专业知识对该研究的深度和广度起到了关键作用。 这项研究不仅提供了ITGB1BP2基因启动子的全新克隆数据，还通过对这些序列的细致分析，揭示了可能影响猪基因表达调控的关键元素，为未来猪遗传改良和基因功能研究奠定了基础。这一成果对于理解动物生理过程，特别是繁殖相关的基因调控，具有重要的理论和实践意义。