3D脑MRI生成新进展:PyTorch实现自动编码生成对抗网络
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更新于2024-11-12
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资源摘要信息:"官方Pytorch实施“使用自动编码的生成对抗网络生成3D脑MRI”(MICACI 2019接受)"
知识点:
1. 生成对抗网络(GANs):GAN是一种深度学习模型,由两部分组成:生成器(Generator)和判别器(Discriminator)。生成器的目标是生成尽可能真实的假数据,而判别器的目标是尽可能准确地区分真实数据和假数据。在本文中,生成对抗网络被用于生成3D脑部MRI。
2. 自动编码器:自动编码器是一种神经网络,其目标是学习输入数据的压缩表示。在本文中,自动编码器被用于辅助生成对抗网络生成3D脑部MRI。
3. Pytorch:Pytorch是一个开源机器学习库,基于Python,主要用于计算机视觉和自然语言处理。在本文中,Pytorch被用于实现生成对抗网络。
4. Jupyter Notebook:Jupyter Notebook是一个开源的web应用程序,允许创建和共享包含实时代码、方程、可视化和文本的文档。在本文中,建议使用Jupyter Notebook,以获得更好的可视化效果。
5. 3D脑部MRI数据集:在本文中,使用了三类MRI数据集,包括正常的MRI数据、肿瘤MRI数据和中风MRI数据。
6. 数据预处理:在本文中,使用了I/O工具将ADNI的所有DICOM(.dcm)文件转换为Nifti(.nii)文件格式。ADNI是一个公开的大型多模态神经影像学研究数据集。
7. 数据后处理:在本文中,使用了Freesurfer的“recon -all”命令对ADNI的MRI数据进行后处理。
8. 第22届医学影像计算和计算机辅助干预国际会议(MICCAI 2019):这是一个关于医学影像计算和计算机辅助干预的国际会议,本文的研究成果被该会议接受。
9. 3dbraingen:这是一个提供3D Brain Generation的PyTorch实现的存储库,可以在GitHub上找到,文件名称为“3dbraingen-master”。
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DaleDai
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