dbSNP数据库中的SNP:人类基因组的常见变异
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更新于2024-08-15
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"SNP概念及其类型-dbSNP数据库"
SNP,全称为Single Nucleotide Polymorphism,中文翻译为“单一核苷酸多型性”,是生物基因组中一个非常重要的遗传变异形式。它指的是在DNA序列中,某个特定位置上的一个碱基对(A、T、C或G)发生了变化,导致该位置存在两种或多种不同的核苷酸状态。这种变异是人类基因组中最常见的可遗传变异,占据了所有已知遗传多态性的90%以上。
在人类基因组中,SNP的分布极其广泛,大约每500到1000个碱基对就会有一个SNP位点。据估计,整个基因组内SNP的数量可能超过300万个,而至今科学家已经鉴定出大约400万个SNPs。
SNP的变异可以分为几种类型。主要的变化方式包括转换(transition)和颠换(transversion)。转换是指嘌呤(A或G)替换为嘌呤,或嘧啶(C或T)替换为嘧啶,如A到G或C到T。颠换则是嘌呤替换为嘧啶,或者嘧啶替换为嘌呤,如A到T或C到G。此外,SNP也可以由碱基的插入或缺失引起,但这通常不被归类为标准的SNP。
dbSNP是SNP的一个重要数据库,由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护。这个数据库收集和整理了全球各地研究者发现的SNP信息,为科研人员提供了一个共享和查询SNP数据的平台。dbSNP不仅对单个SNP的物理位置、频率、功能注释等信息进行记录,还支持SNP与疾病关联性研究、药物反应差异性分析等多领域的科学研究。
SNP的存在对理解个体间的遗传差异具有重要意义。这些差异可以解释为何有些人对某些生活习惯(如吸烟、饮酒)的耐受度不同,或者为什么同一种药物在不同个体间的效果会有所差异。在群体遗传学和演化生物学中,SNP的分析有助于揭示不同族群间的遗传联系和演化历史。而在复杂疾病的研究中,通过连锁不平衡(Linkage Disequilibrium)的分析,SNP可以帮助识别与多基因疾病相关的遗传标记,进而促进疾病的预防和个性化治疗的发展。
SNP作为遗传学中的基本单位,其研究对于理解生物多样性和个体差异,以及推动精准医学的进步起着至关重要的作用。dbSNP数据库则成为了这一研究领域不可或缺的工具,为科学家提供了丰富的数据资源。
2022-06-03 上传
2022-09-21 上传
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慕栗子
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