Chrysalis：快速图像处理与光谱解混的Matlab工具

资源摘要信息:"Chrysalis是一个开源的图像处理软件，主要开发于明尼苏达大学，用于处理静态图像和电影图像。该软件主要应用于2D和3D图像，如共聚焦或落射荧光显微镜获取的图像，以及2光子电影（3D图像+时间）。Chrysalis的主要功能包括彩色补偿、光谱解混和新建频道等。 彩色补偿是一种图像处理技术，用于消除图像颜色失真的问题。在Chrysalis中，彩色补偿是通过GenerateCompensationMatrix脚本实现的。该脚本在斐济运行，并与单色控制图像一起使用以生成补偿矩阵。然后，Chrysalis可以使用此补偿矩阵对图像进行光谱解混。 光谱解混是一种图像处理技术，可以将线性解混应用于图像。这需要用户定义的“补偿矩阵”。在Chrysalis中，光谱解混不仅可以应用于整个图像，也可以应用于图像的特定区域或对象，如创建一个仅包含树突状细胞体素的新通道。 新建频道是Chrysalis的另一个重要功能。这个功能可以根据现有频道的属性生成一个新频道。例如，可以创建一个仅包含树突状细胞体素的新通道，方法是包括CD11c和MHCII通道，但不包括B220，F4/80和CD3通道，并使用CD11c作为该新通道的信号强度。 此外，Chrysalis还具有将电影另存为AVI文件的功能。这使得用户可以快速查看电影，确定哪些电影具有健康的组织，值得进一步分析。 Chrysalis软件的所有代码都是开源的，可以在其官方网站或者GitHub上找到。软件的名称Chrysalis是一个比喻，意为从一个阶段到另一个阶段的转变，就像一只蝴蝶从茧中蜕变出来一样。"