Ubuntu安装AFNI和FSL：详细步骤

"这篇资源主要介绍了在Ubuntu操作系统中如何安装AFNI和FSL这两款用于fMRI数据分析的软件。文章作者提供了详细的步骤，包括检查Ubuntu版本、安装预必需软件、下载并执行AFNI的安装脚本以及安装R包。" 在Ubuntu系统中，安装AFNI这样的专业软件通常涉及多个步骤，尤其是对于依赖于特定库和工具的科学计算软件。首先，用户需要知道自己的Ubuntu版本，因为不同版本的安装方法可能略有差异。这可以通过在终端执行`lsb_release -a`命令来获取。 接下来，安装AFNI之前的一系列预必需软件是必要的。这些软件包括`tcsh`、`xfonts-base`、`python-qt4`、`gsl-bin`、`netpbm`、`gnome-tweak-tool`、`libjpeg62`、`xvfb`、`xterm`、`vim`、`curl`以及相关的开发库如`libglu1-mesa-dev`、`libglw1-mesa`和`libxm4`、`build-essential`。这些软件的安装是通过`apt-get`命令进行的，使用`sudo add-apt-repository universe`添加宇宙软件源，然后`sudo apt-get update`更新软件列表，最后`sudo apt-get install`安装指定的软件包。 AFNI的安装则需要从其官方网站下载安装脚本，例如`curl -O https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/bin/linux_ubuntu_16_64/@update.afni.binaries`。安装脚本`tcsh @update.afni.binaries -package linux_ubuntu_16_64 -do_extras`会根据指定的平台进行安装，并且可能包括额外的组件。安装过程可能较长，完成后需要重启电脑以确保所有更改生效。 在AFNI的使用中，它依赖于R语言的一些工具包。因此，用户需要设置R的库路径，创建`$R_LIBS`并将其指向`$HOME/R`，然后将这个环境变量添加到用户的`~/.bashrc`文件中，确保每次登录时都能找到正确的R包位置。之后，通过下载并执行`@add_rcran_ubuntu.tcsh`脚本，最后使用`rPkgsInstall -pkgs ALL`命令安装所有必要的R包。 这个资源提供了一套完整的AFNI安装教程，适合那些熟悉命令行操作并希望在Ubuntu环境中进行fMRI数据分析的用户。安装过程可能需要一定的时间，但遵循这些步骤能确保AFNI及其依赖项正确安装和配置。