承德玉米中白草花叶病毒3'端cDNA片段的序列分析与系统发育

该研究论文标题为《白草花叶病毒承德玉米分离物3'端cDNA片段序列分析》，由崔小雯、高波、许斐斐和李向东等人合作完成，发表在《中国科技论文在线》。研究对象是来自河北承德的11份表现出矮花叶症状的玉米样品，这些样品被用于检测和分析白草花叶病毒(Pennisetum mosaic virus, PenMV)的遗传特征。 研究人员使用甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus, SCMV)和白草花叶病毒简并引物进行基因组末端大约2.1kb区域的扩增并进行了测序。通过BLAST比对，发现其中有8个样品确认感染了PenMV。这些分离株的PenMV序列全长为2135nt，包括部分NIb基因（985nt）、完整的编码蛋白(CP)基因（909nt）以及3'-非编码区(UTR)（241nt）。这些CP基因和3'-UTR的核苷酸一致性很高，分别达到了89.8%~93.4%和95.9%~97.9%。 系统发育树的构建基于扩增的2135nt序列和CP基因序列，结果显示，这8个承德地区的PenMV分离物与其他已知的PenMV样本被划分为两个群体，即山西组和承德组。进一步的重组分析揭示，其中一个样本的CP基因存在CD9区域的重组现象。 关键词包括白草花叶病毒、玉米、系统发育分析和重组，表明这项研究不仅关注病毒的基因组特性，还探讨了病毒的进化关系和可能的遗传变异。该工作对于理解PenMV在玉米中的分布、传播以及可能的进化策略具有重要意义，也为今后的病毒防控提供了遗传学依据。 这篇论文深入剖析了白草花叶病毒在承德地区玉米中的传播情况，通过对病毒基因组特定区域的序列分析，揭示了病毒的遗传结构和演化趋势，对于植物病毒学和玉米病害防控领域的研究具有重要的科学价值。