BIDS Manager软件:用于导入和组织符合BIDS标准的神经科学数据
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更新于2024-12-02
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资源摘要信息: "BIDS Manager软件是一个为神经科学研究设计的数据管理工具,它遵循BIDS(大脑成像数据结构)标准来导入和组织数据集。该软件的当前版本为v0.2.8,它的BIDS Uploader功能尚未通过SFTP处理数据传输,但开发者计划不久后提供这一功能。BIDS Manager的主要功能是能够收集不同格式的神经科学数据,包括迪康(DICOM)、Micromed(.trc)、脑产品(.vhdr)、EDF+(.edf)以及4D神经影像数据,然后将这些数据以BIDS格式组织。软件还提供了一个图形用户界面(GUI),方便用户可视化和管理BIDS数据集。
BIDS是神经成像领域的一个开放标准,用于组织和共享大脑成像数据和相关元数据。它旨在简化数据共享和协作研究的过程,使得数据可以更易于理解,并能够被各种分析软件工具所处理。
在引用方面,BIDS Manager的相关工作可以在2021年发表的论文《用于多中心研究的电生理和成像数据的传输,收集和组织》中找到,该论文由Roehri,N.等人撰写,发表在《神经信息》期刊上。
BIDS Manager的主要要求包括安装Python 3.7版本的解释器,以及需要安装AnyWave软件和dicm2nii.exe工具。AnyWave是一个用于多模式生物信号数据查看和处理的工具,可以通过提供的URL获取。dicm2nii.exe是一个将DICOM格式的医学影像转换为NIfTI格式的工具。
BIDS Manager通过其图形界面让用户能够更容易地管理数据集,同时也便于用户共享符合BIDS标准的数据,以促进科学社区的合作和数据的可重复性。
标签中的关键词"mri"指的是磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging),这是一种利用强磁场和无线电波获取身体内部详细图片的技术;"bids"已经详细解释过;"anonymization"(匿名化)在处理医疗影像和研究数据时是一个重要步骤,以确保参与者的隐私得到保护;"ieeg"(侵入性脑电图)是指在大脑内部或接近脑表面直接记录电活动的技术。
压缩包子文件的文件名称列表中出现了"BIDS_Manager-master",这表明该项目可能托管在如GitHub这样的代码版本控制和托管平台上,"master"通常表示该文件夹包含的是项目的主分支代码。"BIDS_Manager"后缀表明文件夹内包含的是BIDS Manager项目的文件,而"-master"说明这是主版本或稳定版本的代码库。"压缩包子"可能是输入错误或者是一种不太标准的表述,应当指代为"压缩包文件"。"压缩包文件"是一个文件集合,通常用于数据备份或文件传输,其中的文件被打包压缩成一个单独的文件以便更容易地存储和传输。在本例中,"BIDS_Manager-master"压缩包可能包含了所有必要的源代码文件,以便用户下载和部署BIDS Manager软件。"
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苏鲁定
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