基于随机序列和相关熵的多类别肿瘤基因特征选择

1 下载量 141 浏览量 更新于2024-09-01 1 收藏 422KB PDF 举报
"多类别肿瘤基因表达谱的自动特征选择方法" 本文是一篇研究论文,关注的是在多类别肿瘤基因表达谱数据中的自动特征选择。在生物信息学领域,找到与肿瘤相关的基因以及识别其表达特征对于肿瘤的诊断和治疗具有深远的科学价值。多类别肿瘤基因表达谱数据包含了大量基因在不同类型的肿瘤细胞和正常组织中的表达水平,这些数据的分析有助于理解肿瘤的发生机制和寻找潜在的治疗靶点。 作者提出了一个创新的自动特征选择方法,该方法主要分为两个阶段。首先,他们结合了非参数方法和“filter”思想,利用决策序列的随机性来评估每个基因的重要性。这种方法基于基因表达值的差异性和分布特性,通过计算基因表达的随机性度量,为每个基因分配一个权重,然后按照权重进行排序。这种方法的优势在于它能够捕捉到基因表达模式的复杂性,而不仅仅是简单的平均值或标准差。 其次,为了去除冗余特征,研究人员引入了相关信息熵的概念。冗余特征可能会降低分类模型的性能,因为它们提供了重复的信息。通过计算基因之间的相关熵,可以识别出那些信息重叠的基因,并将它们从特征子集中排除。这一过程旨在保留那些具有高分辨能力和低冗余度的基因,以提高后续分类任务的效率和准确性。 实验结果显示,所提出的方法在多类别肿瘤基因表达谱数据上表现优秀,能够自动选择出大约30个特征基因,这些基因具有强大的分类能力,并且在识别肿瘤类型时能保持较高的正确率。这表明该方法在实际应用中具有很高的潜力,可以帮助科学家更有效地从海量基因数据中筛选出关键的生物标志物。 关键词:肿瘤基因表达谱,特征选择,随机序列,相关信息熵 中图法分类号:TP391(计算机科学技术) 文献标识码:AA(应用基础研究) 这篇研究论文提出了一个有效且实用的策略,用于处理多类别肿瘤基因表达谱数据,通过自动特征选择优化了肿瘤分类任务,对于生物医学研究和临床实践具有重要指导意义。
2024-12-04 上传
2024-12-04 上传