cDNA末端快速扩增技术(RACE)原理与应用
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更新于2024-09-14
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"本文介绍了RACE原理,包括3' RACE和5' RACE技术,以及它们在克隆基因中的应用。RACE技术是一种基于PCR的快速扩增cDNA两端的技术,适用于从低丰度转录本中获取完整基因序列。"
RACE(cDNA末端快速扩增)技术是分子生物学中一种常用的方法,它允许研究人员从已知的部分cDNA序列出发,获取基因的5'和3'末端完整序列。这项技术自1988年由Frohman等人提出以来,经历了多次改进,以提高其效率和特异性。
5' RACE和3' RACE是RACE技术的两个关键组成部分。5' RACE主要用于确定mRNA分子的非编码区,例如启动子序列,而3' RACE则用于获取包含poly(A)尾巴的编码区末端。传统的RACE技术通常涉及反向转录(RT-PCR)过程,使用oligo(dT)引物合成cDNA的第一链,然后进行PCR扩增。
为了优化RACE技术,研究者引入了多种改进策略。例如,使用锁定引物,即在oligo(dT)引物3'端添加简并核苷酸,可以更精确地定位在poly(A)尾的起始点,减少不准确结合的可能性。另外,5'端加尾时使用poly(C)代替poly(A),可以避免二级结构对逆转录的干扰。此外,选择能耐受较高温度的RNase H-莫洛尼氏鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶或嗜热DNA聚合酶,可以更有效地在高温下进行逆转录,降低二级结构对反应的影响。最后,采用热启动PCR和降落PCR技术进一步提高了PCR反应的特异性,减少了非特异性扩增。
随着技术的发展,商业化RACE试剂盒如CLONTECH的MarathonTM技术和SMARTTM RACE技术应运而生,为科研人员提供了更为便捷的解决方案。这些工具简化了实验步骤,提高了实验的成功率,使得RACE技术在基因克隆和功能研究中发挥了重要作用。
RACE原理是分子生物学中一个重要的技术,通过不断的技术革新,它已成为克隆和分析基因5'和3'末端序列的重要手段。无论是学术研究还是工业应用,RACE技术都极大地推动了我们对基因表达和功能的理解。
2023-08-28 上传
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