Oir转Tiff工具:批量并行转码,支持大文件无限制
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更新于2024-11-18
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资源摘要信息:"本工具的主要功能是将Olympus显微镜拍摄的Oir图像文件批量转换成Tiff格式。Oir格式虽然由Olympus显微镜支持,但并非通用图像格式,而Tiff是一种被广泛支持的图像存储格式,具有更好的通用性和兼容性。在图像处理和分析中,转换成Tiff格式可以让更多的图像处理软件进行处理。此外,Olympus自带的转换程序效率低下,并且无法处理超过4GB大小的文件,这使得转换大量数据或大尺寸图像时非常不便。
为了解决这个问题,开发了这款新的转换工具。它使用了并行计算技术,大大提高了转码速度。并行计算是利用现代计算机处理器多核心的优势,同时处理多个计算任务的技术,从而实现更快的数据处理速度。该工具支持Z stacks自动分层,即可以自动处理包含多个Z轴层面的图像序列,这在显微成像中非常常见。
本工具不限制处理文件的大小,支持超过4GB的超大文件,这是一个显著的优势,因为它允许用户处理大型的图像数据集而不会遇到文件大小的限制。然而,如果用户面临内存不足的问题,可以在程序的Parallel Preferences中手动调整并行池的大小,以减少内存的使用。通过减少并行处理的数量,虽然可以减少内存的需求,但也会导致转码过程所需的时间增加。工具还提供了一个单线程模式的版本(Oir2TiffSingle),对于内存资源极其有限的情况,这是一个实用的选择。
初次使用该工具时,可能会遇到错误提示,因为需要添加静态Java路径。但是,这一过程是自动完成的,用户只需按照提示添加路径并重启MATLAB即可。
最后,这个工具是基于MATLAB平台开发的。MATLAB是一种广泛用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算的编程和交互式环境。因此,熟悉MATLAB的用户可以轻松地使用该工具,并对其进行自定义或扩展以适应特定的需求。
标签中提到的“matlab”表明,该工具是专门为MATLAB环境设计的,意味着它的使用依赖于MATLAB软件和相应的MATLAB编程语言。压缩包子文件的文件名称列表中提供的"Oir%E8%BD%ACTiff.zip"表明,用户可以下载包含该转换工具的压缩包,而"Oir%E8%BD%ACTiff.zip"可能是因为编码问题导致的文件名显示异常,实际应该为"Oir2Tiff.zip"。"github_repo.zip"很可能包含了该工具的源代码以及开发文档,如果项目托管在GitHub上,用户可以下载完整的项目仓库进行查看和使用。"
2021-05-15 上传
2023-05-26 上传
2024-10-05 上传
2023-03-26 上传
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2023-07-28 上传
2023-04-08 上传
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