
2.4.
滤液中亲水性和疏水性有机物的表征
通 过 使 用 Superlite DAX-8树 脂 ( Supelco, USA ) 和 Amberlite
XAD-4(Rohm and Hass,USA)分离并分级为三组:强疏水性物质
(被DAX-8吸附)、弱疏水性(或透亲性)物质(被XAD-4吸附)和亲
水性物质(透过DAX-8和XAD-4树脂),分析了膜中的亲水性和疏水性
有机物质。在分析之前,将树脂用甲醇和去离子水洗涤数次以确保它们
不含有机物质,如DOC测量所示。将样品水的pH调节至
2.0
, 然后 通 过
DAX-8
树脂 (以
5 mL min
-1
的速 率) ,然后通过
XAD-4
吸收柱(以
15 mL min
-1
)。根据
DAX-8
和
XAD-4
树脂前后的
DOC
值,确定三种不同组分的浓度使用总有机碳分析仪(
TOC-V
,
Shimadzu
,
Japan
)测定
DOC
值
2.5.
生物膜
zeta
电位和接触角的测定
使用电固体表面分析仪(SurPASS 3,Anton Paar,Austria)测
量生物膜的ζ电位,并使用接触角计(Dataphysics,Germany)测定
生物膜的接触角。对于后者,选择五个随机位置进行测量,并连续记录
值超过200 s。
2.6.
生物膜的扫描电镜和原子力显微镜分析
通过冷冻干燥和在表面上喷涂金属来制备用于
SEM
(
S- 4800
,
Hitachi
)分析的生物膜和膜的样品此后,从表面和横截面上取下图
像以揭示生物膜的三维(
3D
)形态。
为了阐明生物膜粗糙度和物质的分布模式,进行AFM分析。具体
地,使用具有ScanAsyst空气尖端的PeakForce Tapping模式的Bruker
Dimension Icon ScanAsyst ( FASTSCANBIO , Bruker ,
Germany)获得三种生物膜的AFM显微照片。 以0.1-0.3 Hz范围内的
扫描速率和8 - 15 nN之间的峰值力设定点采集扫描(10l m 10lm)。
在数据不确定的情况下,捕获并检查跟踪和回扫扫描。此后,使用
NanoScope分析软件1.8使每个图像变平并清洁以去除扫描缺陷。此
外,使用相同的软件进行颗粒分析,并使用Origin 2018软件(Elec-
tronic Arts Inc.,美国)。
2.7.
生物膜的傅里叶变换红外(
FTIR
)光谱测试
为了鉴定生物膜中的特定官能团,进行FTIR(Spectrum Two,
PerkinElmer,USA)分析。此外,进行FTIR绘图(Spotlight 400)
以视觉显示生物膜中的物质。在所有情况下(三种生物膜)生物膜样品
的长度和宽度设定为500μm,空间分辨率为6.25μ m 6.25lm.以反映
综合生物膜中物质的分布,每个生物膜捕获至少三个图像。
2.8.
生物膜的共聚焦激光扫描显微镜(
CLSM
)图像
然后使用双面胶带粘贴到玻璃盖玻片上。 染色在 一个黑暗 环境
10
1
g·mL
-1
异硫氰酸荧光素(
FITC
,
二氨基-2-苯基吲哚(DAPI;对每个生物膜进行间歇染色和冲洗,染色程
序持续30分钟,然后用磷酸盐缓冲液冲洗;重复数次。通过CLSM(TCS
SP 5,Leica,Germany)观察盖玻片上蛋白质、多糖和eDNA的存在
[31使用具有相应Ex和Em波长的三个使用ImageJ软件(USA)处理通
过CLSM获得的z
2.9.
分子实验与生物信息学分析
应用高通量测序技术提供关于生物膜中细菌群落的详细信息选择
16S
核糖体
RNA
(
rRNA
)
V4
区域作为扩增子,认为其在结构域和门
水平上产生最大的多样性
[35]
。使用蛋白酶
K
和基于十二烷基硫酸钠
的裂解
[36]
,从面积约为
6.25 cm
2
的
生物膜中提取
DNA
,并根据制造
商 的 方 案 用
DNA Clean and Concentrator-25 Kit
(
Zymo
Research
,
USA
)纯化此后,通过紫外(
UV
)光谱法在
230
、
260
和
280 nm
波长下评价
DNA
质量(吸光度:
260 nm/280 nm
,
~ 1.8;
260 nm/230 nm
,
> 1.8
),使用
NanoDrop-1000
分光光度计检测
(
NanoDrop Technologies
,
USA
),并通过
0.8%
琼脂糖凝胶电泳
评估
DNA
完整性。最后,将整个
DNA
储存在
20°C
下直到聚合酶链式
反应(
PCR
)扩增。
用通用引物扩增16SrRNAV4
区域,含有
正向
引物
515 F
(
50
-GTGCCAGCMGCCGCGG
TAA-3
0
)
和反
向引物806 R
(
50
-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-
3
0
)
[35]
。
添加条形码
以
区分不同
的
样品,并使用具有GC缓冲液的高保真PCR主混合物(New
England Biolabs,USA)进行扩增。经过一系列 在反应[37]中,产生
PCR产物;因此,将一式三份PCR产物合并并使用1%琼脂糖凝胶电泳可
视 化 。 此 外 , 用GeneJET PCR 纯 化 试 剂 盒 ( Thermo Scientific,
USA ) 纯 化 PCR 产 物 , 使 用 Qubit dsDNA HS 测 定 试 剂 盒
(Invitrogen,USA)定量,并以等摩尔浓度合并用于随后的测序。使
用Ion Plus Fragment Library Kit 48 rxns(Ion Torrent,USA)制
备样品文库,并在Novogene Bioinformatics Institute使用单端方法用
Ion S5
TM
XL测序仪(Thermo Scientific)测序。此后,将正向和反向读
段连接并基于条形码分配给不同的样品。修剪每个读段结束时的引物序
列和条形码。丢弃具有不明确碱基、长度小于100 bp或平均质量评分小
于20的任何连接序列。与参考数据集(Greengenes数据库
y
)[38]相
比,从干净序列中删除嵌合序列。只有有效序列用于进一步分析。因
此,使用UPARSE流水线[39]以97%核苷酸相似性的截止值将序列聚类
为操作分类单位(OTU),并使用核糖体数据库项目分类器以0.8的置
信阈值对每个OTU的代表性序列进行分类学分类[40]。
新鲜的生物膜与膜固定用
2.5%
甲醛,
y
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