
医学信息学解锁21(2020)100440
使用语义分割网络对脑缺血和白质高信号病变进行全自动分割,
磁共振成像中的挤压
-
激发阻滞
A-Reum Lee
a
,Ilsang Woo
a
,Dong-Wha Kang
b
,Seung Chai Jung
c
,Hyunna Lee
a
,
Namkug Kim a
,
*
a
蔚山大学医学院牙山医学中心生物医学工程研究中心融合医学系,
88 Olympic-Ro 43-Gil
,
首尔市松坡区,邮编
05505
b
蔚山大学神经病学系,医学院,牙山医疗中心,
88 Olympic-Ro 43-Gil
,
Songpa-Gu
,
Seoul
,
05505
,韩国
c
韩国
,首尔,
05505
,松坡区,
88 Olympic-Ro 43-Gil
,蔚山大学,医学院,牙山医疗中心,放射科和放射学研究所
A R T I C L E I N FO
保留字:
脑缺血病灶分割深度学习
扩散加权成像(
DWI
)医学图像分
割语义分割
挤压
-
激发(
SE
)阻滞
A B S T R A C T
缺血性脑卒中是老年人的常见病,可导致长期残疾和死亡。急性期脑缺血性病变的定量测量对脑卒中患者的准
确诊断和治疗决策至关重要。目前,缺血性病变的手动分割是耗时的,并且难以提取潜在的量化信息。这些限
制可以通过深度学习来克服,深度学习最近已经成为在MRI中分割脑缺血性病变的流行方法。使用深度学习的
全自动分割方法可定量评估梗死病变,准确识别病变,快速定位病变,并改善治疗计划。最先进的方法是U-Net
的变体,是全卷积网络(FCN);然而,这些方法有一些限制,包括由于编码器和解码器网络而无法捕获全局特
征
为了克服这一局限性,本研究提出了一种使用挤压和激励(SE)块的U-网的语义分割方法。与传统的神经网
络相比,该方法可以通过特征映射来改善通道信息,从而提高脑病变分割的准确性
经IRB批准,急性梗死患者(N= 429)回顾性入组本研究
开发了各种类型的带有或不带有SE块的语义分割网络,并将其准确性与传统的内部和商业软件进行了比较U-的
Dice相似系数(DSC)
带SE块的致密U形网和Net分别为85.39±0.84和84.23±1.60DSC增加3.5%
平均0.9%。具有SE块的基本U形网和密集U形网的准确性显著优于传统图像处理方法和不具有SE块的图像处理
方法(p值分别为:1.0e-08、2.272e-05和0.0003)。为了进一步评估这些方法,使用了MICCAI 2017的白质高
信号(WMH)分割挑战的公共数据集。在WMH数据集中,U-Net的DSC与或
无SE阻滞时分别为74.64±1.11和76.92±0.78DSC平均提高2.3%的
与SE块的语义分割表现出显着更好的性能比那些没有SE块。该解决方案可以应用于测量各种脑分割问题,包括
梗死体积(在中风患者的急性期)和WMH体积。
1.
介绍
各种脑部疾病可以通过磁共振成像(MRI)进行分割和量化。然而,
由于繁琐的任务和复杂的环境,稳健和精确的分割和量化仍然是一个挑
战。
观察者间和观察者内的差异。
计算机视觉中具有深度学习的最先进算法已应用于生物医学成像,
并在医学图像处理中表现出出色的性能,包括分类、检测、分割和病变
量化
* 通讯作者。
电子邮件地址:
namkugkim@gmail.com(N.Kim)。
https://doi.org/10.1016/j.imu.2020.100440
接收日期:2020年7月23日;接收日期:2020年9月26日;接受日期:2020年9月30日
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医学信息学
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